תוצאות חיפוש

IDBA – A Practical Iterative de Bruijn Graph De Novo Assembler מאת Yu Peng, Henry C. M. Leung, Siu‐Ming Yiu, Francis Y. L. Chin

קבל טקסט מלא

Read mapping on de Bruijn graphs מאת Antoine Limasset, Bastien Cazaux, Éric Rivals, Pierre Peterlongo

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

Variable-Order de Bruijn Graphs מאת Christina Boucher, Alex Bowe, Travis Gagie, Simon J. Puglisi, Kunihiko Sadakane

קבל טקסט מלא

Reference-free compression of high throughput sequencing data with a probabilistic de Bruijn graph מאת Gaëtan Benoit, Claire Lemaitre, Dominique Lavenier, Erwan Drézen, Thibault Dayris, Raluca Uricaru, Guillaume Rizk

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

The khmer software package: enabling efficient nucleotide sequence analysis מאת Michael R. Crusoe, Hussien F. Alameldin, Sherine Awad, Elmar Boucher, Adam Caldwell, Reed A. Cartwright, Amanda Charbonneau, Bede Constantinides, Greg Edvenson, Scott Fay, Jacob Fenton, Thomas Fenzl, Jordan Fish, Leonor García-Gutierrez, Phillip Garland, Jonathan Gluck, Iván González, Sarah Guermond, Jiarong Guo, Aditi Gupta, Joshua R. Herr, Adina Howe, Alex Hyer, Andreas Härpfer, Luiz Irber, Rhys Kidd, David Lin, Justin Lippi, Tamer Mansour, Pamela McA'Nulty, Eric McDonald, Jessica E. Mizzi, Kevin Murray, Joshua Nahum, Kaben Nanlohy, Alexander J. Nederbragt, Humberto Ortiz‐Zuazaga, Jeramia Ory, Jason Pell, Charles Pepe‐Ranney, Zachary N. Russ, Erich M. Schwarz, Camille Scott, Josiah Seaman, Scott Sievert, Jared T. Simpson, Connor T. Skennerton, James S. Spencer, S. Ramakrishnan, Daniel Standage, James A. Stapleton, Susan R. Steinman, J.J. Stein, Benjamin Taylor, Will Trimble, Heather L. Wiencko, Michael Wright, Brian Wyss, Qingpeng Zhang, en zyme, C. Titus Brown

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

On the Representation of de Bruijn Graphs מאת Rayan Chikhi, Antoine Limasset, Shaun D. Jackman, Jared T. Simpson, Paul Medvedev

קבל טקסט מלא

SEQuel: improving the accuracy of genome assemblies מאת Roy Ronen, Christina Boucher, Hamidreza Chitsaz, Pavel A. Pevzner

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

Assembly algorithms for next-generation sequencing data מאת Jason Miller, Sergey Koren, Granger Sutton

קבל טקסט מלא

Parallel De Bruijn Graph Construction and Traversal for De Novo Genome Assembly מאת Evangelos Georganas, Aydın Buluç, Jarrod Chapman, Leonid Oliker, Daniel S. Rokhsar, Katherine Yelick

קבל טקסט מלא

Comparison of the two major classes of assembly algorithms: overlap-layout-consensus and de-bruijn-graph מאת Zhenyu Li, Y. Chen, Dezhi Mu, Jianying Yuan, Yongyong Shi, Haiyang Zhang, Jinping Gan, Ning‐Zhe Li, Xuesong Hu, B. Liu, Bin Yang, Wei Fan

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

HipMer מאת Evangelos Georganas, Aydın Buluç, Jarrod Chapman, Steven Hofmeyr, Chaitanya Aluru, Rob Egan, Leonid Oliker, Daniel S. Rokhsar, Katherine Yelick

קבל טקסט מלא

Exploiting sparseness in de novo genome assembly מאת Chengxi Ye, Zhanshan Sam, Charles H. Cannon, Mihai Pop, Douglas W. Yu

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

De novo assembly and genotyping of variants using colored de Bruijn graphs מאת Zamin Iqbal, Mario Cáccamo, Isaac Turner, Paul Flicek, Gil McVean

קבל טקסט מלא

Disk-based k-mer counting on a PC מאת Sebastian Deorowicz, Agnieszka Debudaj-Grabysz, Szymon Grabowski

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

Maximum Likelihood Genome Assembly מאת Paul Medvedev, Michael Brudno

קבל טקסט מלא

Cactus Graphs for Genome Comparisons מאת Benedict Paten, Mark Diekhans, Dent Earl, John St. John, Jian Ma, Bernard Suh, David Haussler

קבל טקסט מלא

How to apply de Bruijn graphs to genome assembly מאת Phillip E. C. Compeau, Pavel A. Pevzner, Glenn Tesler

קבל טקסט מלא

Comparative analysis of de novo transcriptome assembly מאת Kaitlin Clarke, Yi Yang, Ronald Marsh, Linglin Xie, Zhang Ke K.

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

Readjoiner: a fast and memory efficient string graph-based sequence assembler מאת Giorgio Gonnella, Stefan Kurtz

קבל טקסט מלא קבל טקסט מלא

Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study מאת Louise Cerdeira, Adriana Ribeiro Carneiro, Rommel Thiago Jucá Ramos, S. Almeida, Vivian D ́Afonseca, Maria Paula Cruz Schneider, Jan Baumbach, Andreas Tauch, John Anthony McCulloch, Vasco Azevedo, Artur Silva

קבל טקסט מלא