The covariance environment defines cellular niches for spatial inference

The covariance environment defines cellular niches for spatial inference

A key challenge of analyzing data from high-resolution spatial profiling technologies is to suitably represent the features of cellular neighborhoods or niches. Here we introduce the covariance environment (COVET), a representation that leverages the gene-gene covariate structure across cells in the...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autoři: Doron Haviv, Ján Remšík, Mohamed I. Gatie, Catherine Snopkowski, Meril Takizawa, Nathan Pereira, John Bashkin, Stevan Jovanovich, Tal Nawy, Ronan Chaligné, Adrienne Boire, Anna‐Katerina Hadjantonakis, Dana Pe’er
Médium: Artigo
Jazyk:angličtina
Vydáno: 2024
On-line přístup:https://doi.org/10.1038/s41587-024-02193-4
https://www.nature.com/articles/s41587-024-02193-4.pdf
Tagy: Přidat tag
Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Internet

https://doi.org/10.1038/s41587-024-02193-4
https://www.nature.com/articles/s41587-024-02193-4.pdf

Podobné jednotky