Evaluation of methods for oligonucleotide array data via quantitative real-time PCR

Evaluation of methods for oligonucleotide array data via quantitative real-time PCR

There are currently many different methods for processing and summarizing probe-level data from Affymetrix oligonucleotide arrays. It is of great interest to validate these methods and identify those that are most effective. There is no single best way to do this validation, and a variety of approac...

Mô tả đầy đủ

Đã lưu trong:

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Li-Xuan Qin, Richard P. Beyer, Francesca N. Hudson, Nancy J. Linford, Daryl E. Morris, Kathleen F. Kerr
Định dạng:	Artigo
Ngôn ngữ:	Tiếng Anh
Được phát hành:	2006
Truy cập trực tuyến:	https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-23 https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/counter/pdf/10.1186/1471-2105-7-23
Các nhãn:	Thêm thẻ Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự

Evaluation of methods for oligonucleotide array data via quantitative real-time PCR
Bằng: Qin, Li-Xuan, et al.
Được phát hành: (2006)

External oligonucleotide standards enable cross laboratory comparison and exchange of real-time quantitative PCR data
Bằng: Vermeulen, Joëlle, et al.
Được phát hành: (2009)

Validation of Oligonucleotide Microarray Data Using Microfluidic Low-Density Arrays: a New Statistical Method to Normalize Real-Time RT-PCR Data
Bằng: Lynne V. Abruzzo, et al.
Được phát hành: (2005)

Quantitative Real-Time PCR
Bằng: Sluijter, J. P. G., et al.
Được phát hành: (2006)

Real time quantitative PCR.
Bằng: Chris Heid, et al.
Được phát hành: (1996)

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays
Bằng: Chugh, Pauline, et al.
Được phát hành: (2010)

Comparison of array comparative genomic hybridization and quantitative real-time PCR-based aneuploidy screening of blastocyst biopsies
Bằng: Capalbo, Antonio, et al.
Được phát hành: (2015)

Systematic Evaluation of Three microRNA Profiling Platforms: Microarray, Beads Array, and Quantitative Real-Time PCR Array
Bằng: Wang, Bin, et al.
Được phát hành: (2011)

Systematic Evaluation of Three microRNA Profiling Platforms: Microarray, Beads Array, and Quantitative Real-Time PCR Array
Bằng: Bin Wang, et al.
Được phát hành: (2011)

cDNA‐arrays and real‐time quantitative PCR techniques in the investigation of chronic achilles tendinosis
Bằng: Håkan Alfredson, et al.
Được phát hành: (2003)

Q-Gene: processing quantitative real-time RT–PCR data
Bằng: Perikles Simon
Được phát hành: (2003)

SATQPCR: Website for statistical analysis of real-time quantitative PCR data
Bằng: Corinne Rancurel, et al.
Được phát hành: (2019)

HTqPCR: high-throughput analysis and visualization of quantitative real-time PCR data in R
Bằng: Dvinge, Heidi, et al.
Được phát hành: (2009)

Oligonucleotide chip, real-time PCR and sequencing for genotyping of hepatitis B virus
Bằng: Wang, Yong-Zhong, et al.
Được phát hành: (2007)

P53-M Real-Time PCR Array for Multi-Gene Expression Profiling and Microarray Data Validation: RT(2) Profiler PCR Array
Bằng: Arikawa, E., et al.
Được phát hành: (2007)

Real-time PCR quantitation of glucocorticoid receptor alpha isoform
Bằng: Melo, Murilo R, et al.
Được phát hành: (2004)

Real-Time PCR for mRNA Quantitation
Bằng: Marisa L. Wong, et al.
Được phát hành: (2005)

Comparison of array comparative genomic hybridization and quantitative real-time PCR-based aneuploidy screening of blastocyst biopsies
Bằng: Antonio Capalbo, et al.
Được phát hành: (2014)

Gene expression levels assessed by oligonucleotide microarray analysis and quantitative real-time RT-PCR – how well do they correlate?
Bằng: Dallas, Peter B, et al.
Được phát hành: (2005)

Gene expression levels assessed by oligonucleotide microarray analysis and quantitative real-time RT-PCR – how well do they correlate?
Bằng: Peter B. Dallas, et al.
Được phát hành: (2005)

Real-time PCR quantitation of glucocorticoid receptor alpha isoform.
Bằng: Murilo Rezende Melo, et al.
Được phát hành: (2004)

Quantitative Real-Time Legionella PCR for Environmental Water Samples: Data Interpretation
Bằng: Joly, Philippe, et al.
Được phát hành: (2006)

RDML: structured language and reporting guidelines for real-time quantitative PCR data
Bằng: Lefever, Steve, et al.
Được phát hành: (2009)

RDML: structured language and reporting guidelines for real-time quantitative PCR data
Bằng: Steve Lefever, et al.
Được phát hành: (2009)

Guidelines for Optimisation of a Multiplex Oligonucleotide Ligation-PCR for Characterisation of Microbial Pathogens in a Microsphere Suspension Array
Bằng: Wuyts, Véronique, et al.
Được phát hành: (2015)

Correction of Spatial Bias in Oligonucleotide Array Data
Bằng: Serhal, Philippe, et al.
Được phát hành: (2013)

Real-time detection of DNA hybridization and melting on oligonucleotide arrays by using optical wave guides.
Bằng: Stimpson, D I, et al.
Được phát hành: (1995)

Real-time detection of DNA hybridization and melting on oligonucleotide arrays by using optical wave guides.
Bằng: Donald I. Stimpson, et al.
Được phát hành: (1995)

A Real-Time PCR Array for Hierarchical Identification of Francisella Isolates
Bằng: Svensson, Kerstin, et al.
Được phát hành: (2009)

A Real-Time PCR Array for Hierarchical Identification of Francisella Isolates
Bằng: Kerstin Svensson, et al.
Được phát hành: (2009)

Microarray validation: factors influencing correlation between oligonucleotide microarrays and real-time PCR
Bằng: Morey, Jeanine S., et al.
Được phát hành: (2006)

Microarray validation: factors influencing correlation between oligonucleotide microarrays and real-time PCR
Bằng: Jeanine S. Morey, et al.
Được phát hành: (2006)

Quantitative Real-Time PCR Is Not More Sensitive than “Conventional” PCR
Bằng: Bastien, Patrick, et al.
Được phát hành: (2008)

Digital PCR dynamic range is approaching that of real-time quantitative PCR
Bằng: Jones, Gerwyn M., et al.
Được phát hành: (2016)

Digital PCR dynamic range is approaching that of real-time quantitative PCR
Bằng: Gerwyn M. Jones, et al.
Được phát hành: (2016)

Evaluation and Validation of a Real-Time PCR Assay for Detection and Quantitation of Human Adenovirus 14 from Clinical Samples
Bằng: Metzgar, David, et al.
Được phát hành: (2009)

Experimental validation of novel and conventional approaches to quantitative real-time PCR data analysis
Bằng: Peirson, Stuart N., et al.
Được phát hành: (2003)

Experimental validation of novel and conventional approaches to quantitative real-time PCR data analysis
Bằng: Stuart N. Peirson
Được phát hành: (2003)

Real-Time Quantitative PCR for Detection of Helicobacter pylori
Bằng: He, Qiang, et al.
Được phát hành: (2002)

Real-Time PCR for Quantitative Detection of Toxoplasma gondii
Bằng: Lin, Mei-Hui, et al.
Được phát hành: (2000)