Résultats de la recherche - Yuichi Shiraishi

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    A Simple Model-Based Approach to Inferring and Visualizing Cancer Mutation Signatures

    A Simple Model-Based Approach to Inferring and Visualizing Cancer Mutation Signatures par Yuichi Shiraishi, Georg Tremmel, Satoru Miyano, Matthew Stephens

    Publié 2015
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  2. 2
    ClipCrop: a tool for detecting structural variations with single-base resolution using soft-clipping information

    ClipCrop: a tool for detecting structural variations with single-base resolution using soft-clipping information par Shin Suzuki, Tomohiro Yasuda, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Masao Nagasaki

    Publié 2011
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  3. 3
    Systematically developing a registry of splice-site creating variants utilizing massive publicly available transcriptome sequence data

    Systematically developing a registry of splice-site creating variants utilizing massive publicly available transcriptome sequence data par Naoko Iida, Ai Okada, Yoshihisa Kobayashi, Kenichi Chiba, Yasushi Yatabe, Yuichi Shiraishi

    Publié 2025
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  4. 4
    A comprehensive characterization of <i>cis</i>-acting splicing-associated variants in human cancer

    A comprehensive characterization of <i>cis</i>-acting splicing-associated variants in human cancer par Yuichi Shiraishi, Keisuke Kataoka, Kenichi Chiba, Ai Okada, Yasunori Kogure, Hiroko Tanaka, Seishi Ogawa, Satoru Miyano

    Publié 2018
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  5. 5
    Precise characterization of somatic complex structural variations from tumor/control paired long-read sequencing data with nanomonsv

    Precise characterization of somatic complex structural variations from tumor/control paired long-read sequencing data with nanomonsv par Yuichi Shiraishi, Junji Koya, Kenichi Chiba, Ai Okada, Yasuhito Arai, Yuki Saito, Tatsuhiro Shibata, Keisuke Kataoka

    Publié 2023
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  6. 6
    C-CAT: The National Datacenter for Cancer Genomic Medicine in Japan

    C-CAT: The National Datacenter for Cancer Genomic Medicine in Japan par Takashi Kohno, Mamoru Kato, Shinji Kohsaka, Tomohisa Sudo, Ikuo Tamai, Yuichi Shiraishi, Yusuke Okuma, Daisuke Ogasawara, Tatsuya Suzuki, Teruhiko Yoshida, Hiroyuki Mano

    Publié 2022
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  7. 7
    Deep sequencing reveals stepwise mutation acquisition in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria

    Deep sequencing reveals stepwise mutation acquisition in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria par Wenyi Shen, Michael J. Clemente, Naoko Hosono, Kenichi Yoshida, Bartlomiej Przychodzen, Tetsuichi Yoshizato, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Seishi Ogawa, Jaroslaw P. Maciejewski, Hideki Makishima

    Publié 2014
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  8. 8
    Phasing analysis of lung cancer genomes using a long read sequencer

    Phasing analysis of lung cancer genomes using a long read sequencer par Yoshitaka Sakamoto, Shuhei Miyake, Miho Oka, Akinori Kanai, Yosuke Kawai, Satoi Nagasawa, Yuichi Shiraishi, Katsushi Tokunaga, Takashi Kohno, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Ayako Suzuki

    Publié 2022
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  9. 9
    An empirical Bayesian framework for somatic mutation detection from cancer genome sequencing data

    An empirical Bayesian framework for somatic mutation detection from cancer genome sequencing data par Yuichi Shiraishi, Yusuke Sato, Kenichi Chiba, Yusuke Okuno, Yasunobu Nagata, Kenichi Yoshida, Norio Shiba, Yasuhide Hayashi, Haruki Kume, Yukio Homma, Masashi Sanada, Seishi Ogawa, Satoru Miyano

    Publié 2013
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  10. 10
    Variant ALDH2 is associated with accelerated progression of bone marrow failure in Japanese Fanconi anemia patients

    Variant ALDH2 is associated with accelerated progression of bone marrow failure in Japanese Fanconi anemia patients par Asuka Hira, Hiromasa Yabe, Kenichi Yoshida, Yusuke Okuno, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Jun Nakamura, Seiji Kojima, Seishi Ogawa, Keitaro Matsuo, Minoru Takata, Miharu Yabe

    Publié 2013
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  11. 11
    Comprehensive analysis of indels in whole-genome microsatellite regions and microsatellite instability across 21 cancer types

    Comprehensive analysis of indels in whole-genome microsatellite regions and microsatellite instability across 21 cancer types par Akihiro Fujimoto, Masashi Fujita, Takanori Hasegawa, Jing Hao Wong, Kazuhiro Maejima, Aya Oku‐Sasaki, Kaoru Nakano, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Go Yamamoto, Kiwamu Akagi, Seiya Imoto, Hidewaki Nakagawa

    Publié 2020
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  12. 12
    Long-read sequencing for non-small-cell lung cancer genomes

    Long-read sequencing for non-small-cell lung cancer genomes par Yoshitaka Sakamoto, Liu Xu, Masahide Seki, Toshiyuki Yokoyama, Masahiro Kasahara, Yukie Kashima, Akihiro Ohashi, Yoko Shimada, Noriko Motoi, Katsuya Tsuchihara, Susumu Kobayashi, Takashi Kohno, Yuichi Shiraishi, Ayako Suzuki, Yutaka Suzuki

    Publié 2020
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  13. 13
    Mutations in the Gene Encoding the E2 Conjugating Enzyme UBE2T Cause Fanconi Anemia

    Mutations in the Gene Encoding the E2 Conjugating Enzyme UBE2T Cause Fanconi Anemia par Asuka Hira, Kenichi Yoshida, Koichi Sato, Yusuke Okuno, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Akira Shimamoto, Hidetoshi Tahara, Etsuro Ito, Seiji Kojima, Hitoshi Kurumizaka, Seishi Ogawa, Minoru Takata, Hiromasa Yabe, Miharu Yabe

    Publié 2015
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  14. 14
    <i>TERT</i> promoter mutations and chromosome 8p loss are characteristic of nonalcoholic fatty liver disease‐related hepatocellular carcinoma

    <i>TERT</i> promoter mutations and chromosome 8p loss are characteristic of nonalcoholic fatty liver disease‐related hepatocellular carcinoma par Soo Ki Kim, Yoshihide Ueda, Etsuro Hatano, Nobuyuki Kakiuchi, Haruhiko Takeda, Tomoyuki Gotō, Takahiro Shimizu, Kenichi Yoshida, Yoshihiro Ikura, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Shinji Üemoto, Tsutomu Chiba, Seishi Ogawa, Hiroyuki Marusawa

    Publié 2016
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  15. 15
    Aberrant splicing of U12-type introns is the hallmark of ZRSR2 mutant myelodysplastic syndrome

    Aberrant splicing of U12-type introns is the hallmark of ZRSR2 mutant myelodysplastic syndrome par Vikas Madan, Deepika Kanojia, Jia Li, Ryoko Okamoto, Aiko Sato‐Otsubo, Alexander Kohlmann, Masashi Sanada, Vera Großmann, Janani Sundaresan, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Felicitas Thol, Arnold Ganser, Henry Yang, Torsten Haferlach, Seishi Ogawa, H. Phillip Koeffler

    Publié 2015
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  16. 16
    Gene expression and risk of leukemic transformation in myelodysplasia

    Gene expression and risk of leukemic transformation in myelodysplasia par Yusuke Shiozawa, Luca Malcovati, Anna Gallì, Andrea Pellagatti, Mohsen Karimi, Aiko Sato‐Otsubo, Yusuke Sato, Hiromichi Suzuki, Tetsuichi Yoshizato, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hideki Makishima, Jacqueline Boultwood, Eva Hellström‐Lindberg, Satoru Miyano, Mario Cazzola, Seishi Ogawa

    Publié 2017
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  17. 17
    Aberrant splicing and defective mRNA production induced by somatic spliceosome mutations in myelodysplasia

    Aberrant splicing and defective mRNA production induced by somatic spliceosome mutations in myelodysplasia par Yusuke Shiozawa, Luca Malcovati, Anna Gallì, Aiko Sato‐Otsubo, Keisuke Kataoka, Yusuke Sato, Yosaku Watatani, Hiromichi Suzuki, Tetsuichi Yoshizato, Kenichi Yoshida, Masashi Sanada, Hideki Makishima, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Eva Hellström‐Lindberg, Satoru Miyano, Seishi Ogawa, Mario Cazzola

    Publié 2018
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  18. 18
    Soluble PD-L1 works as a decoy in lung cancer immunotherapy via alternative polyadenylation

    Soluble PD-L1 works as a decoy in lung cancer immunotherapy via alternative polyadenylation par Ray Sagawa, Seiji Sakata, Bo Gong, Yosuke Seto, Ai Takemoto, Satoshi Takagi, Hironori Ninomiya, Noriko Yanagitani, Masayuki Nakao, Mingyon Mun, Ken Uchibori, Makoto Nishio, Yasunari Miyazaki, Yuichi Shiraishi, Seishi Ogawa, Keisuke Kataoka, Naoya Fujita, Kengo Takeuchi, Ryohei Katayama

    Publié 2021
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  19. 19
    Recurrent genetic defects on chromosome 7q in myeloid neoplasms

    Recurrent genetic defects on chromosome 7q in myeloid neoplasms par Naoko Hosono, Hideki Makishima, Andrés Jerez, Kenichi Yoshida, Bartlomiej Przychodzen, Sarah McMahon, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Masashi Sanada, Inés Gómez‐Seguí, Amit Verma, Michael A. McDevitt, Mikkael A. Sekeres, Seishi Ogawa, J. Maciejewski

    Publié 2014
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  20. 20
    Early detection and evolution of preleukemic clones in therapy-related myeloid neoplasms following autologous SCT

    Early detection and evolution of preleukemic clones in therapy-related myeloid neoplasms following autologous SCT par Gerbrig Berger, Leonie I. Kroeze, Theresia N. Koorenhof‐Scheele, Aniek O. de Graaf, Kenichi Yoshida, Hiroo Ueno, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Eva van den Berg, Hein Schepers, Bert A. van der Reijden, Seishi Ogawa, Edo Vellenga, Joop H. Jansen

    Publié 2018
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