Résultats de la recherche - Shivashankar H. Nagaraj

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    A Boolean-based systems biology approach to predict novel genes associated with cancer: Application to colorectal cancer

    A Boolean-based systems biology approach to predict novel genes associated with cancer: Application to colorectal cancer par Shivashankar H. Nagaraj, Antônio Reverter

    Publié 2011
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  2. 2
    A hitchhiker's guide to expressed sequence tag (EST) analysis

    A hitchhiker's guide to expressed sequence tag (EST) analysis par Shivashankar H. Nagaraj, Robin B. Gasser, Shoba Ranganathan

    Publié 2006
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  3. 3
    The evolution of tropical adaptation: comparing taurine and zebu cattle

    The evolution of tropical adaptation: comparing taurine and zebu cattle par Eva K.F. Chan, Shivashankar H. Nagaraj, Antônio Reverter

    Publié 2010
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  4. 4
    ESTExplorer: an expressed sequence tag (EST) assembly and annotation platform

    ESTExplorer: an expressed sequence tag (EST) assembly and annotation platform par Shivashankar H. Nagaraj, Nilesh Deshpande, Robin B. Gasser, Shoba Ranganathan

    Publié 2007
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  5. 5
    Deep Learning-Based Pan-Cancer Classification Model Reveals Tissue-of-Origin Specific Gene Expression Signatures

    Deep Learning-Based Pan-Cancer Classification Model Reveals Tissue-of-Origin Specific Gene Expression Signatures par Mayur Divate, Aayush Tyagi, Derek J. Richard, Prathosh A. Prasad, Harsha Gowda, Shivashankar H. Nagaraj

    Publié 2022
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  6. 6
    Proteomics Analysis of the Excretory/Secretory Component of the Blood-feeding Stage of the Hookworm, Ancylostoma caninum

    Proteomics Analysis of the Excretory/Secretory Component of the Blood-feeding Stage of the Hookworm, Ancylostoma caninum par Jason Mulvenna, Brett R. Hamilton, Shivashankar H. Nagaraj, Danielle J. Smyth, Alex Loukas, Jeffrey J. Gorman

    Publié 2008
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  7. 7
    Interrogation of Phenotypic Plasticity between Epithelial and Mesenchymal States in Breast Cancer

    Interrogation of Phenotypic Plasticity between Epithelial and Mesenchymal States in Breast Cancer par Sugandha Bhatia, James Monkman, Tony Blick, Cletus Pinto, Mark Waltham, Shivashankar H. Nagaraj, Erik W. Thompson

    Publié 2019
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  8. 8
    A comparative study of multi-omics integration tools for cancer driver gene identification and tumour subtyping

    A comparative study of multi-omics integration tools for cancer driver gene identification and tumour subtyping par Anita Sathyanarayanan, Rohit Gupta, Erik W. Thompson, Dale R. Nyholt, Denis C. Bauer, Shivashankar H. Nagaraj

    Publié 2019
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  9. 9
    Bridging genomics’ greatest challenge: The diversity gap

    Bridging genomics’ greatest challenge: The diversity gap par Manuel Corpas, Mkpouto Pius, Marie Poburennaya, Heinner Guio, Miriam Dwek, Shivashankar H. Nagaraj, C. Correa, Alice B. Popejoy, Segun Fatumo

    Publié 2024
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  10. 10
    Transcriptional Changes in the Hookworm, Ancylostoma caninum, during the Transition from a Free-Living to a Parasitic Larva

    Transcriptional Changes in the Hookworm, Ancylostoma caninum, during the Transition from a Free-Living to a Parasitic Larva par Bennett Datu, Robin B. Gasser, Shivashankar H. Nagaraj, Eng Kok Ong, P. J. O’Donoghue, Russell McInnes, Shoba Ranganathan, Alex Loukas

    Publié 2008
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  11. 11
    Association weight matrix for the genetic dissection of puberty in beef cattle

    Association weight matrix for the genetic dissection of puberty in beef cattle par Marina R. S. Fortes, Antônio Reverter, Yuandan Zhang, Eliza Collis, Shivashankar H. Nagaraj, N.N. Jonsson, Kishore C. Prayaga, Wes Barris, Rachel Hawken

    Publié 2010
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  12. 12
    A single nucleotide polymorphism-derived regulatory gene network underlying puberty in 2 tropical breeds of beef cattle1

    A single nucleotide polymorphism-derived regulatory gene network underlying puberty in 2 tropical breeds of beef cattle1 par Marina R. S. Fortes, Antônio Reverter, Shivashankar H. Nagaraj, Y. Zhang, N.N. Jonsson, W Barris, Sigrid A. Lehnert, G. Boe-Hansen, Rachel Hawken

    Publié 2011
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  13. 13
    High-throughput functional annotation and data mining with the Blast2GO suite

    High-throughput functional annotation and data mining with the Blast2GO suite par Stefan Götz, Juan M. García‐Gómez, Javier Terol, Tim Williams, Shivashankar H. Nagaraj, María José Nueda, Montserrat Robles, Manuel Talón, Joaquı́n Dopazo, Ana Conesa

    Publié 2008
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  14. 14
    Pharmacological induction of chromatin remodeling drives chemosensitization in triple-negative breast cancer

    Pharmacological induction of chromatin remodeling drives chemosensitization in triple-negative breast cancer par Meisam Bagheri, Gadisti A. Mohamed, Mohammed Ashick Mohamed Saleem, Nevena B. Ognjenovic, Hanxu Lu, Fred Kolling, Owen M. Wilkins, Subhadeep Das, Ian S. LaCroix, Shivashankar H. Nagaraj, Kristen E. Muller, Scott A. Gerber, Todd W. Miller, Diwakar R. Pattabiraman

    Publié 2024
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  15. 15
    Unlocking capacities of genomics for the COVID-19 response and future pandemics

    Unlocking capacities of genomics for the COVID-19 response and future pandemics par Sergey Knyazev, Karishma Chhugani, Varuni Sarwal, Ram Ayyala, Harman Singh, Smruthi Karthikeyan, Dhrithi Deshpande, Pelin Icer Baykal, Zoia Comarova, Angela Lu, Yuri B. Porozov, Tetyana I. Vasylyeva, Joel O. Wertheim, Braden Tierney, Charles Y. Chiu, Ren Sun, Aiping Wu, Malak Abedalthagafi, Victoria M. Pak, Shivashankar H. Nagaraj, Adam L. Smith, Pavel Skums, Bogdan Paşaniuc, Andrey B. Komissarov, Christopher E. Mason, Eric Bortz, Philippe Lemey, Fyodor A. Kondrashov, Niko Beerenwinkel, Tommy Tsan‐Yuk Lam, Nicholas C. Wu, Alex Zelikovsky, Rob Knight, Keith A. Crandall, Serghei Mangul

    Publié 2022
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  16. 16
    Whole-genome landscape of pancreatic neuroendocrine tumours

    Whole-genome landscape of pancreatic neuroendocrine tumours par Aldo Scarpa, David K. Chang, Kátia Nones, Vincenzo Corbo, Ann‐Marie Patch, Peter J. Bailey, Rita T. Lawlor, Amber L. Johns, David K. Miller, Andrea Mafficini, Borislav C. Rusev, Maria Scardoni, Davide Antonello, Stefano Barbi, Katarzyna Sikora, Sara Cingarlini, Caterina Vicentini, Skye McKay, Michael C. Quinn, Timothy J. C. Bruxner, Angelika N. Christ, Ivon Harliwong, Senel Idrisoglu, Suzanne McLean, Craig Nourse, Ehsan Nourbakhsh, Peter J. Wilson, Matthew J. Anderson, J. Lynn Fink, Felicity Newell, Nick M. Waddell, Oliver Holmes, Stephen H. Kazakoff, Conrad Leonard, Scott Wood, Qinying Xu, Shivashankar H. Nagaraj, Eliana Amato, Irene Dalai, Samantha Bersani, Ivana Cataldo, Angelo Paolo Dei Tos, Paola Capelli, Maria Vittoria Davì, Luca Landoni, Anna Malpaga, Marco Miotto, Vicki Whitehall, Barbara Leggett, Janelle L. Harris, Jonathan M. Harris, Marc D. Jones, Jeremy L. Humphris, Lorraine A. Chantrill, Venessa Chin, Adnan Nagrial, Marina Pajic, Christopher J. Scarlett, Andreia V. Pinho, Ilse Rooman, Christopher W. Toon, Jianmin Wu, Mark Pinese, Mark J. Cowley, Andrew P. Barbour, Amanda Mawson, Emily S. Humphrey, Emily K. Colvin, Angela Chou, Jessica A. Lovell, Nigel B. Jamieson, Fraser R. Duthie, Marie‐Claude Gingras, William E. Fisher, Rebecca A. Dagg, Loretta M. S. Lau, Michael Lee, Hilda A. Pickett, Roger R. Reddel, Jaswinder S. Samra, James G. Kench, Neil D. Merrett, Krishna Epari, Nam Q. Nguyen, Nikolajs Zeps, Massimo Falconi, Michele Simbolo, Giovanni Butturini, George Van Buren, Stefano Partelli, Matteo Fassan, Kum Kum Khanna, Anthony J. Gill, David A. Wheeler, Richard A. Gibbs, Elizabeth A. Musgrove, Claudio Bassi, Giampaolo Tortora, Paolo Pederzoli, John V. Pearson

    Publié 2017
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