Résultats de la recherche - Shantanu Chowdhury

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    QuadBase2: web server for multiplexed guanine quadruplex mining and visualization

    QuadBase2: web server for multiplexed guanine quadruplex mining and visualization par Parashar Dhapola, Shantanu Chowdhury

    Publié 2016
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  2. 2
    Emerging mechanisms of telomerase reactivation in cancer

    Emerging mechanisms of telomerase reactivation in cancer par Shalu Sharma, Shantanu Chowdhury

    Publié 2022
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  3. 3
    Non-duplex G-Quadruplex Structures Emerge as Mediators of Epigenetic Modifications

    Non-duplex G-Quadruplex Structures Emerge as Mediators of Epigenetic Modifications par Ananda Kishore Mukherjee, Shalu Sharma, Shantanu Chowdhury

    Publié 2018
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  4. 4
    Non-duplex G-Quadruplex DNA Structure: A Developing Story from Predicted Sequences to DNA Structure-Dependent Epigenetics and Beyond

    Non-duplex G-Quadruplex DNA Structure: A Developing Story from Predicted Sequences to DNA Structure-Dependent Epigenetics and Beyond par Antara Sengupta, Shuvra Shekhar Roy, Shantanu Chowdhury

    Publié 2020
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  5. 5
    Genome-Wide Analyses of Recombination Prone Regions Predict Role of DNA Structural Motif in Recombination

    Genome-Wide Analyses of Recombination Prone Regions Predict Role of DNA Structural Motif in Recombination par Prithvi Mani, Vinod Kumar Yadav, Swapan K. Das, Shantanu Chowdhury

    Publié 2009
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  6. 6
    Evidence of genome-wide G4 DNA-mediated gene expression in human cancer cells

    Evidence of genome-wide G4 DNA-mediated gene expression in human cancer cells par Anjali Verma, Vinod Kumar Yadav, Richa Basundra, Akinchan Kumar, Shantanu Chowdhury

    Publié 2009
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  7. 7
    QuadBase: genome-wide database of G4 DNA occurrence and conservation in human, chimpanzee, mouse and rat promoters and 146 microbes

    QuadBase: genome-wide database of G4 DNA occurrence and conservation in human, chimpanzee, mouse and rat promoters and 146 microbes par Vinod Kumar Yadav, J.K. Abraham, Prita Mani, R. Kulshrestha, Shantanu Chowdhury

    Publié 2007
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  8. 8
    Zinc-finger transcription factors are associated with guanine quadruplex motifs in human, chimpanzee, mouse and rat promoters genome-wide

    Zinc-finger transcription factors are associated with guanine quadruplex motifs in human, chimpanzee, mouse and rat promoters genome-wide par Pankaj Kumar, Vinod Kumar Yadav, Aradhita Baral, Parveen Kumar, Dhurjhoti Saha, Shantanu Chowdhury

    Publié 2011
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  9. 9
    Microsatellite Tandem Repeats Are Abundant in Human Promoters and Are Associated with Regulatory Elements

    Microsatellite Tandem Repeats Are Abundant in Human Promoters and Are Associated with Regulatory Elements par Sterling Sawaya, Andrew Bagshaw, Emmanuel Buschiazzo, Pankaj Kumar, Shantanu Chowdhury, Michael A. Black, Neil J. Gemmell

    Publié 2013
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  10. 10
    Genome-wide study predicts promoter-G4 DNA motifs regulate selective functions in bacteria: radioresistance of D. radiodurans involves G4 DNA-mediated regulation

    Genome-wide study predicts promoter-G4 DNA motifs regulate selective functions in bacteria: radioresistance of D. radiodurans involves G4 DNA-mediated regulation par Nicolas Beaume, Rajiv Pathak, Vinod Kumar Yadav, Swathi Kota, Hari S. Misra, Hemant K. Gautam, Shantanu Chowdhury

    Publié 2012
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  11. 11
    Quadruplex-single nucleotide polymorphisms (Quad-SNP) influence gene expression difference among individuals

    Quadruplex-single nucleotide polymorphisms (Quad-SNP) influence gene expression difference among individuals par Aradhita Baral, Pankaj Kumar, Rashi Halder, Prithvi Mani, Vinod Kumar Yadav, Ankita Singh, Swapan K. Das, Shantanu Chowdhury

    Publié 2012
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  12. 12
    Genome-wide distribution of histone H4 Lysine 16 acetylation sites and their relationship to gene expression

    Genome-wide distribution of histone H4 Lysine 16 acetylation sites and their relationship to gene expression par Nobuo Horikoshi, Pankaj Kumar, Girdhar G. Sharma, Min Chen, Clayton R. Hunt, Kenneth D. Westover, Shantanu Chowdhury, Tej K. Pandita

    Publié 2013
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  13. 13
    Metastases suppressor NM23-H2 interaction with G-quadruplex DNA within c-MYC promoter nuclease hypersensitive element induces c-MYC expression

    Metastases suppressor NM23-H2 interaction with G-quadruplex DNA within c-MYC promoter nuclease hypersensitive element induces c-MYC expression par Ram Krishna Thakur, Praveen Kumar, Kangkan Halder, Anjali Verma, Anirban Kar, Jean‐Luc Parent, Richa Basundra, Akinchan Kumar, Shantanu Chowdhury

    Publié 2008
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  14. 14
    Genome-wide prediction of G4 DNA as regulatory motifs: Role in<i>Escherichia coli</i>global regulation

    Genome-wide prediction of G4 DNA as regulatory motifs: Role in<i>Escherichia coli</i>global regulation par Pooja Rawal, Veera Bhadra Rao Kummarasetti, Jinoy Ravindran, Nirmal Kumar, Kangkan Halder, Rakesh Sharma, Mitali Mukerji, Swapan K. Das, Shantanu Chowdhury

    Publié 2006
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  15. 15
    Epigenetic suppression of human telomerase (hTERT) is mediated by the metastasis suppressor NME2 in a G-quadruplex–dependent fashion

    Epigenetic suppression of human telomerase (hTERT) is mediated by the metastasis suppressor NME2 in a G-quadruplex–dependent fashion par Dhurjhoti Saha, Ankita Singh, Tabish Hussain, Vivek Srivastava, Suman Sengupta, Anirban Kar, Parashar Dhapola, Vishnu M. Dhople, Ramesh Ummanni, Shantanu Chowdhury

    Publié 2017
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  16. 16
    Genome-wide analysis reveals downregulation of miR-379/miR-656 cluster in human cancers

    Genome-wide analysis reveals downregulation of miR-379/miR-656 cluster in human cancers par Saurabh V. Laddha, Subhashree Nayak, Deepanjan Paul, Rajasekhara Reddy, Charu Sharma, Prerana Jha, Manoj Hariharan, Anurag Agrawal, Shantanu Chowdhury, Chitra Sarkar, Arijit Mukhopadhyay

    Publié 2013
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  17. 17
    Telomere length-dependent transcription and epigenetic modifications in promoters remote from telomere ends

    Telomere length-dependent transcription and epigenetic modifications in promoters remote from telomere ends par Ananda Kishore Mukherjee, Shalu Sharma, Suman Sengupta, Dhurjhoti Saha, Pankaj Kumar, Tabish Hussain, Vivek Srivastava, Sumitabho Deb Roy, Jerry W. Shay, Shantanu Chowdhury

    Publié 2018
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  18. 18
    Telomere repeat–binding factor 2 binds extensively to extra-telomeric G-quadruplexes and regulates the epigenetic status of several gene promoters

    Telomere repeat–binding factor 2 binds extensively to extra-telomeric G-quadruplexes and regulates the epigenetic status of several gene promoters par Ananda Kishore Mukherjee, Shalu Sharma, Sulochana Bagri, Rintu Kutum, Pankaj Kumar, Asgar Hussain, Prateek Singh, Dhurjhoti Saha, Anirban Kar, Debasis Dash, Shantanu Chowdhury

    Publié 2019
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  19. 19
    Human telomerase is directly regulated by non-telomeric TRF2-G-quadruplex interaction

    Human telomerase is directly regulated by non-telomeric TRF2-G-quadruplex interaction par Shalu Sharma, Ananda Kishore Mukherjee, Shuvra Shekhar Roy, Sulochana Bagri, Silje Lier, Meenakshi Verma, Antara Sengupta, Manish Kumar, Gaute Nesse, Deo Prakash Pandey, Shantanu Chowdhury

    Publié 2021
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  20. 20
    DNA damage-induced ephrin-B2 reverse signaling promotes chemoresistance and drives EMT in colorectal carcinoma harboring mutant p53

    DNA damage-induced ephrin-B2 reverse signaling promotes chemoresistance and drives EMT in colorectal carcinoma harboring mutant p53 par Sk. Kayum Alam, Vinod Kumar Yadav, Swati Bajaj, Arindam Datta, Shamit K. Dutta, Madhumita Bhattacharyya, Sayantani Sarkar Bhattacharya, Subrata Debnath, Siddhartha Roy, Lisa A. Boardman, Thomas C. Smyrk, Jennifer R. Molina, Susmita Chakrabarti, Shantanu Chowdhury, Debaditya Mukhopadhyay, Susanta Roychoudhury

    Publié 2015
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