Torthaí cuardaigh - Roy Sushmita

Chromatin module inference on cellular trajectories identifies key transition points and poised epigenetic states in diverse developmental processes de réir Roy, Sushmita, Sridharan, Rupa

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Inference of cell type specific regulatory networks on mammalian lineages de réir Chasman, Deborah, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

ISMB 2022 proceedings de réir Dessimoz, Christophe, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A prior-based integrative framework for functional transcriptional regulatory network inference de réir Siahpirani, Alireza F., Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A prior-based integrative framework for functional transcriptional regulatory network inference de réir Siahpirani, Alireza F., Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

GRiNCH: simultaneous smoothing and detection of topological units of genome organization from sparse chromatin contact count matrices with matrix factorization de réir Lee, Da-Inn, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A system for generating transcription regulatory networks with combinatorial control of transcription de réir Roy, Sushmita, Werner-Washburne, Margaret, Lane, Terran

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Learning structurally consistent undirected probabilistic graphical models de réir Roy, Sushmita, Lane, Terran, Werner-Washburne, Margaret

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A multiple network learning approach to capture system-wide condition-specific responses de réir Roy, Sushmita, Werner-Washburne, Margaret, Lane, Terran

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A multi-task graph-clustering approach for chromosome conformation capture data sets identifies conserved modules of chromosomal interactions de réir Fotuhi Siahpirani, Alireza, Ay, Ferhat, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Reliable prediction of regulator targets using 12 Drosophila genomes de réir Kheradpour, Pouya, Stark, Alexander, Roy, Sushmita, Kellis, Manolis

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

A Pan-Cancer Modular Regulatory Network Analysis to Identify Common and Cancer-Specific Network Components de réir Knaack, Sara A, Siahpirani, Alireza Fotuhi, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Reconstruction and analysis of the evolution of modular transcriptional regulatory programs using Arboretum de réir Knaack, Sara A., Thompson, Dawn A., Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

In silico prediction of high-resolution Hi-C interaction matrices de réir Zhang, Shilu, Chasman, Deborah, Knaack, Sara, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Data integration for inferring context-specific gene regulatory networks de réir Baur, Brittany, Shin, Junha, Zhang, Shilu, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Scalable learning of large networks de réir Roy, Sushmita, Plis, Sergey, Werner-Washburne, Margaret, Lane, Terran

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Physiological Responses and Gene Co-Expression Network of Mycorrhizal Roots under K(+) Deprivation de réir Garcia, Kevin, Chasman, Deborah, Roy, Sushmita, Ané, Jean-Michel

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Exploiting Amino Acid Composition for Predicting Protein-Protein Interactions de réir Roy, Sushmita, Martinez, Diego, Platero, Harriett, Lane, Terran, Werner-Washburne, Margaret

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Donor Hematopoietic Stem Cells Confer Long-Term Marrow Reconstitution by Self-Renewal Divisions Exceeding to That of Host Cells de réir Roy, Sushmita, Javed, Saleem, Jain, Swatantra K., Majumdar, Subeer S., Mukhopadhyay, Asok

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán

Multi-task consensus clustering of genome-wide transcriptomes from related biological conditions de réir Niu, Zhen, Chasman, Deborah, Eisfeld, Amie J., Kawaoka, Yoshihiro, Roy, Sushmita

Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán Faigh an téacs iomlán