Rezultaty - Ollikainen, Noah

Computational Protein Design Quantifies Structural Constraints on Amino Acid Covariation od Ollikainen, Noah, Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Structural analysis of the evolution of steroid specificity in the mineralocorticoid and glucocorticoid receptors od Baker, Michael E, Chandsawangbhuwana, Charlie, Ollikainen, Noah

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Coupling Protein Side-Chain and Backbone Flexibility Improves the Re-design of Protein-Ligand Specificity od Ollikainen, Noah, de Jong, René M., Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Methods in Enzymology: “Flexible backbone sampling methods to model and design protein alternative conformations” od Ollikainen, Noah, Smith, Colin A., Fraser, James S., Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Quantification of the transferability of a designed protein specificity switch reveals extensive epistasis in molecular recognition od Melero, Cristina, Ollikainen, Noah, Harwood, Ian, Karpiak, Joel, Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Amino-acid site variability among natural and designed proteins od Jackson, Eleisha L., Ollikainen, Noah, Covert, Arthur W., Kortemme, Tanja, Wilke, Claus O.

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Widespread Protein Aggregation as an Inherent Part of Aging in C. elegans od David, Della C., Ollikainen, Noah, Trinidad, Jonathan C., Cary, Michael P., Burlingame, Alma L., Kenyon, Cynthia

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A Web Resource for Standardized Benchmark Datasets, Metrics, and Rosetta Protocols for Macromolecular Modeling and Design od Ó Conchúir, Shane, Barlow, Kyle A., Pache, Roland A., Ollikainen, Noah, Kundert, Kale, O'Meara, Matthew J., Smith, Colin A., Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Integrated spatial genomics reveals global architecture of single nuclei od Takei, Yodai, Yun, Jina, Zheng, Shiwei, Ollikainen, Noah, Pierson, Nico, White, Jonathan, Shah, Sheel, Thomassie, Julian, Suo, Shengbao, Eng, Chee-Huat Linus, Guttman, Mitchell, Yuan, Guo-Cheng, Cai, Long

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

RNA promotes the formation of spatial compartments in the nucleus od Quinodoz, Sofia A., Jachowicz, Joanna W., Bhat, Prashant, Ollikainen, Noah, Banerjee, Abhik K., Goronzy, Isabel N., Blanco, Mario R., Chovanec, Peter, Chow, Amy, Markaki, Yolanda, Thai, Jasmine, Plath, Kathrin, Guttman, Mitchell

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Comparative proteogenomics: Combining mass spectrometry and comparative genomics to analyze multiple genomes od Gupta, Nitin, Benhamida, Jamal, Bhargava, Vipul, Goodman, Daniel, Kain, Elisabeth, Kerman, Ian, Nguyen, Ngan, Ollikainen, Noah, Rodriguez, Jesse, Wang, Jian, Lipton, Mary S., Romine, Margaret, Bafna, Vineet, Smith, Richard D., Pevzner, Pavel A.

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Systems-level effects of allosteric perturbations to a model molecular switch od Perica, Tina, Mathy, Christopher J. P., Xu, Jiewei, Jang, Gwendolyn M., Zhang, Yang, Kaake, Robyn, Ollikainen, Noah, Braberg, Hannes, Swaney, Danielle L., Lambright, David G., Kelly, Mark J. S., Krogan, Nevan J., Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Computational design of a modular protein sense/response system od Glasgow, Anum A., Huang, Yao-Ming, Mandell, Daniel J., Thompson, Michael, Ritterson, Ryan, Loshbaugh, Amanda L., Pellegrino, Jenna, Krivacic, Cody, Pache, Roland A., Barlow, Kyle A., Ollikainen, Noah, Jeon, Deborah, Kelly, Mark J. S., Fraser, James S., Kortemme, Tanja

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Higher-order inter-chromosomal hubs shape 3D genome organization in the nucleus od Quinodoz, Sofia A., Ollikainen, Noah, Tabak, Barbara, Palla, Ali, Schmidt, Jan Marten, Detmar, Elizabeth, Lai, Mason M., Shishkin, Alexander A., Bhat, Prashant, Takei, Yodai, Trinh, Vickie, Aznauryan, Erik, Russell, Pamela, Cheng, Christine, Jovanovic, Marko, Chow, Amy, Cai, Long, McDonel, Patrick, Garber, Manuel, Guttman, Mitchell

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

SARS-CoV-2 Disrupts Splicing, Translation, and Protein Trafficking to Suppress Host Defenses od Banerjee, Abhik K., Blanco, Mario R., Bruce, Emily A., Honson, Drew D., Chen, Linlin M., Chow, Amy, Bhat, Prashant, Ollikainen, Noah, Quinodoz, Sofia A., Loney, Colin, Thai, Jasmine, Miller, Zachary D., Lin, Aaron E., Schmidt, Madaline M., Stewart, Douglas G., Goldfarb, Daniel, De Lorenzo, Giuditta, Rihn, Suzannah J., Voorhees, Rebecca M., Botten, Jason W., Majumdar, Devdoot, Guttman, Mitchell

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Macromolecular modeling and design in Rosetta: recent methods and frameworks od Koehler Leman, Julia, Weitzner, Brian D, Lewis, Steven M, Adolf-Bryfogle, Jared, Alam, Nawsad, Alford, Rebecca F, Aprahamian, Melanie, Baker, David, Barlow, Kyle A, Barth, Patrick, Basanta, Benjamin, Bender, Brian J, Blacklock, Kristin, Bonet, Jaume, Boyken, Scott, Bradley, Phil, Bystroff, Chris, Conway, Patrick, Cooper, Seth, Correia, Bruno E, Coventry, Brian, Das, Rhiju, De Jong, René M, DiMaio, Frank, Dsilva, Lorna, Dunbrack, Roland, Ford, Alex, Frenz, Brandon, Fu, Darwin Y, Geniesse, Caleb, Goldschmidt, Lukasz, Gowthaman, Ragul, Gray, Jeffrey J, Gront, Dominik, Guffy, Sharon, Horowitz, Scott, Huang, Po-Ssu, Huber, Thomas, Jacobs, Tim M, Jeliazkov, Jeliazko R, Johnson, David K, Kappel, Kalli, Karanicolas, John, Khakzad, Hamed, Khar, Karen R, Khare, Sagar D, Khatib, Firas, Khramushin, Alisa, King, Indigo C, Kleffner, Robert, Koepnick, Brian, Kortemme, Tanja, Kuenze, Georg, Kuhlman, Brian, Kuroda, Daisuke, Labonte, Jason W, Lai, Jason K, Lapidoth, Gideon, Leaver-Fay, Andrew, Lindert, Steffen, Linsky, Thomas, London, Nir, Lubin, Joseph H, Lyskov, Sergey, Maguire, Jack, Malmström, Lars, Marcos, Enrique, Marcu, Orly, Marze, Nicholas A, Meiler, Jens, Moretti, Rocco, Mulligan, Vikram Khipple, Nerli, Santrupti, Norn, Christoffer, Ó’Conchúir, Shane, Ollikainen, Noah, Ovchinnikov, Sergey, Pacella, Michael S, Pan, Xingjie, Park, Hahnbeom, Pavlovicz, Ryan E, Pethe, Manasi, Pierce, Brian G, Pilla, Kala Bharath, Raveh, Barak, Renfrew, P Douglas, Roy Burman, Shourya S, Rubenstein, Aliza, Sauer, Marion F, Scheck, Andreas, Schief, William, Schueler-Furman, Ora, Sedan, Yuval, Sevy, Alexander M, Sgourakis, Nikolaos G, Shi, Lei, Siegel, Justin, Silva, Daniel-Adriano, Smith, Shannon, Song, Yifan, Stein, Amelie, Szegedy, Maria, Teets, Frank D, Thyme, Summer B, Wang, Ray Yu-Ruei, Watkins, Andrew, Zimmerman, Lior, Bonneau, Richard

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe