Resultados da busca - Mihaela Pertea

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    The Human Transcriptome: An Unfinished Story

    The Human Transcriptome: An Unfinished Story por Mihaela Pertea

    Publicado em 2012
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  2. 2
    GeneSplicer: a new computational method for splice site prediction

    GeneSplicer: a new computational method for splice site prediction por Mihaela Pertea

    Publicado em 2001
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  3. 3
    GFF Utilities: GffRead and GffCompare

    GFF Utilities: GffRead and GffCompare por Geo Pertea, Mihaela Pertea

    Publicado em 2020
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  4. 4
    GFF Utilities: GffRead and GffCompare

    GFF Utilities: GffRead and GffCompare por Geo Pertea, Mihaela Pertea

    Publicado em 2020
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  5. 5
    Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes

    Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes por Mihaela Pertea, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2010
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  6. 6
    Computational Gene Prediction Using Multiple Sources of Evidence

    Computational Gene Prediction Using Multiple Sources of Evidence por Jonathan Allen, Mihaela Pertea, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2004
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  7. 7
    A computational survey of candidate exonic splicing enhancer motifs in the model plant Arabidopsis thaliana

    A computational survey of candidate exonic splicing enhancer motifs in the model plant Arabidopsis thaliana por Mihaela Pertea, Stephen M. Mount, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2007
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  8. 8
    TigrScan and GlimmerHMM: two open source <i>ab initio</i> eukaryotic gene-finders

    TigrScan and GlimmerHMM: two open source <i>ab initio</i> eukaryotic gene-finders por William H. Majoros, Mihaela Pertea, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2004
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  9. 9
    Improved transcriptome assembly using a hybrid of long and short reads with StringTie

    Improved transcriptome assembly using a hybrid of long and short reads with StringTie por Alaina Shumate, Brandon Wong, Geo Pertea, Mihaela Pertea

    Publicado em 2022
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  10. 10
    OperonDB: a comprehensive database of predicted operons in microbial genomes

    OperonDB: a comprehensive database of predicted operons in microbial genomes por Mihaela Pertea, Kunmi Ayanbule, M. Smedinghoff, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2008
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  11. 11
    Rapid detection of inter-clade recombination in SARS-CoV-2 with Bolotie

    Rapid detection of inter-clade recombination in SARS-CoV-2 with Bolotie por Ales Varabyou, Christopher Pockrandt, Steven L. Salzberg, Mihaela Pertea

    Publicado em 2021
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  12. 12
    JIGSAW, GeneZilla, and GlimmerHMM: puzzling out the features of human genes in the ENCODE regions.

    JIGSAW, GeneZilla, and GlimmerHMM: puzzling out the features of human genes in the ENCODE regions. por Jonathan Allen, William H. Majoros, Mihaela Pertea, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2006
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  13. 13
    Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown

    Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown por Mihaela Pertea, Daehwan Kim, Geo Pertea, Jeffrey T. Leek, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2016
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  14. 14
    Human contamination in bacterial genomes has created thousands of spurious proteins

    Human contamination in bacterial genomes has created thousands of spurious proteins por Florian P. Breitwieser, Mihaela Pertea, Aleksey V. Zimin, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2019
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  15. 15
    The first gapless, reference-quality, fully annotated genome from a Southern Han Chinese individual

    The first gapless, reference-quality, fully annotated genome from a Southern Han Chinese individual por Kuan-Hao Chao, Aleksey V. Zimin, Mihaela Pertea, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2023
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  16. 16
    Interpolated Markov Models for Eukaryotic Gene Finding

    Interpolated Markov Models for Eukaryotic Gene Finding por Steven L. Salzberg, Mihaela Pertea, Arthur L. Delcher, Malcolm J. Gardner, Hervé Tettelin

    Publicado em 1999
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  17. 17
    Genome-wide annotation of microRNA primary transcript structures reveals novel regulatory mechanisms

    Genome-wide annotation of microRNA primary transcript structures reveals novel regulatory mechanisms por Tsung-Cheng Chang, Mihaela Pertea, Sung‐Yul Lee, Steven L. Salzberg, Joshua T. Mendell

    Publicado em 2015
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  18. 18
    StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA-seq reads

    StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA-seq reads por Mihaela Pertea, Geo Pertea, Corina Antonescu, Tsung-Cheng Chang, Joshua T. Mendell, Steven L. Salzberg

    Publicado em 2015
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  19. 19
    Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2

    Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2 por Sam Kovaka, Aleksey V. Zimin, Geo Pertea, Roham Razaghi, Steven L. Salzberg, Mihaela Pertea

    Publicado em 2019
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  20. 20
    Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2

    Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2 por Sam Kovaka, Aleksey V. Zimin, Geo Pertea, Roham Razaghi, Steven L. Salzberg, Mihaela Pertea

    Publicado em 2019
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