Результати пошуку - Mark Chaisson

Уточнити результати
  1. 1
    Mapping single molecule sequencing reads using basic local alignment with successive refinement (BLASR): application and theory

    Mapping single molecule sequencing reads using basic local alignment with successive refinement (BLASR): application and theory за авторством Mark Chaisson, Glenn Tesler

    Опубліковано 2012
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  2. 2
    lra: A long read aligner for sequences and contigs

    lra: A long read aligner for sequences and contigs за авторством Jingwen Ren, Mark Chaisson

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  3. 3
    Short read fragment assembly of bacterial genomes

    Short read fragment assembly of bacterial genomes за авторством Mark Chaisson, Pavel A. Pevzner

    Опубліковано 2007
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  4. 4
    vamos: variable-number tandem repeats annotation using efficient motif sets

    vamos: variable-number tandem repeats annotation using efficient motif sets за авторством Jingwen Ren, Bida Gu, Mark Chaisson

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  5. 5
    De novo fragment assembly with short mate-paired reads: Does the read length matter?

    De novo fragment assembly with short mate-paired reads: Does the read length matter? за авторством Mark Chaisson, Dumitru Brinza, Pavel A. Pevzner

    Опубліковано 2008
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  6. 6
    Genetic variation and the de novo assembly of human genomes

    Genetic variation and the de novo assembly of human genomes за авторством Mark Chaisson, Richard K. Wilson, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2015
    Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  7. 7
    Paired de Bruijn Graphs: A Novel Approach for Incorporating Mate Pair Information into Genome Assemblers

    Paired de Bruijn Graphs: A Novel Approach for Incorporating Mate Pair Information into Genome Assemblers за авторством Paul Medvedev, Son Pham, Mark Chaisson, Glenn Tesler, Pavel A. Pevzner

    Опубліковано 2011
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  8. 8
    The motif composition of variable number tandem repeats impacts gene expression

    The motif composition of variable number tandem repeats impacts gene expression за авторством Tsung-Yu Lu, Paulina N. Smaruj, Geoffrey Fudenberg, Nicholas Mancuso, Mark Chaisson

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  9. 9
    Advances in the discovery and analyses of human tandem repeats

    Advances in the discovery and analyses of human tandem repeats за авторством Mark Chaisson, Arvis Sulovari, Paul N. Valdmanis, Danny E. Miller, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  10. 10
    Assembly of long error-prone reads using de Bruijn graphs

    Assembly of long error-prone reads using de Bruijn graphs за авторством Yu Lin, Jeffrey Yuan, Mikhail Kolmogorov, Max W. Shen, Mark Chaisson, Pavel A. Pevzner

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  11. 11
    STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner

    STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner за авторством Alexander Dobin, Carrie Davis, Felix Schlesinger, Jörg Drenkow, Chris Zaleski, Sonali Jha, Philippe Batut, Mark Chaisson, T Gingeras

    Опубліковано 2012
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  12. 12
    Profiling variable-number tandem repeat variation across populations using repeat-pangenome graphs

    Profiling variable-number tandem repeat variation across populations using repeat-pangenome graphs за авторством Tsung-Yu Lu, Katherine M. Munson, Alexandra P. Lewis, Qihui Zhu, Luke J. Tallon, Scott E. Devine, Charles Lee, Evan E. Eichler, Mark Chaisson

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  13. 13
    Reconstructing complex regions of genomes using long-read sequencing technology

    Reconstructing complex regions of genomes using long-read sequencing technology за авторством John Huddleston, Swati Ranade, Maika Malig, Francesca Antonacci, Mark Chaisson, Lawrence Hon, Peter H. Sudmant, Tina Graves, Can Alkan, Megan Y. Dennis, Richard K. Wilson, Stephen W. Turner, Jonas Korlach, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2014
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  14. 14
    Resolving the complexity of the human genome using single-molecule sequencing

    Resolving the complexity of the human genome using single-molecule sequencing за авторством Mark Chaisson, John Huddleston, Megan Y. Dennis, Peter H. Sudmant, Maika Malig, Fereydoun Hormozdiari, Francesca Antonacci, Urvashi Surti, Richard Sandstrom, Matthew Boitano, Jane M. Landolin, J Stamatoyannopoulos, Michael W. Hunkapiller, Jonas Korlach, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2014
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  15. 15
    Discovery and genotyping of structural variation from long-read haploid genome sequence data

    Discovery and genotyping of structural variation from long-read haploid genome sequence data за авторством John Huddleston, Mark Chaisson, Karyn Meltz Steinberg, Wes Warren, Kendra Hoekzema, David Gordon, Tina A. Graves-Lindsay, Katherine M. Munson, Zev Kronenberg, Laura Vives, Paul Peluso, Matthew Boitano, Chen-Shin Chin, Jonas Korlach, Richard K. Wilson, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  16. 16
    Long-read sequence assembly of the gorilla genome

    Long-read sequence assembly of the gorilla genome за авторством David Gordon, John Huddleston, Mark Chaisson, C. Hill, Zev Kronenberg, Katherine M. Munson, Maika Malig, Archana N. Raja, Ian T. Fiddes, LaDeana Hillier, Christopher Dunn, Carl Baker, Joel Armstrong, Mark Diekhans, Benedict Paten, Jay Shendure, Richard K. Wilson, David Haussler, Chen-Shan Chin, Evan E. Eichler

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  17. 17
    Fully phased human genome assembly without parental data using single-cell strand sequencing and long reads

    Fully phased human genome assembly without parental data using single-cell strand sequencing and long reads за авторством David Porubský, Peter Ebert, Peter A. Audano, Mitchell R. Vollger, William T. Harvey, Pierre Marijon, Jana Ebler, Katherine M. Munson, Melanie Sorensen, Arvis Sulovari, Marina Haukness, Maryam Ghareghani, Peter M. Lansdorp, Benedict Paten, Scott E. Devine, Ashley D. Sanders, Charles Lee, Mark Chaisson, Jan O. Korbel, Evan E. Eichler, Tobias Marschall

    Опубліковано 2020
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  18. 18
    Expectations and blind spots for structural variation detection from long-read assemblies and short-read genome sequencing technologies

    Expectations and blind spots for structural variation detection from long-read assemblies and short-read genome sequencing technologies за авторством Xuefang Zhao, Ryan L. Collins, Wan‐Ping Lee, Alexandra M. Weber, Yukyung Jun, Qihui Zhu, Ben Weisburd, Yongqing Huang, Peter A. Audano, Harold Wang, Mark Walker, Chelsea Lowther, Jack Fu, Mark Gerstein, Scott E. Devine, Tobias Marschall, Jan O. Korbel, Evan E. Eichler, Mark Chaisson, Charles Lee, Ryan E. Mills, Harrison Brand, Michael E. Talkowski

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  19. 19
    Scalable Nanopore sequencing of human genomes provides a comprehensive view of haplotype-resolved variation and methylation

    Scalable Nanopore sequencing of human genomes provides a comprehensive view of haplotype-resolved variation and methylation за авторством Mikhail Kolmogorov, Kimberley J. Billingsley, Mira Mastoras, Melissa Meredith, Jean Monlong, Ryan Lorig-Roach, Mobin Asri, Pilar Álvarez Jerez, Laksh Malik, Ramita Dewan, Xylena Reed, Rylee M. Genner, Kensuke Daida, Sairam Behera, Kishwar Shafin, Trevor Pesout, Jeshuwin Prabakaran, P. Carnevali, Jianzhi Yang, Arang Rhie, Sonja W. Scholz, Bryan J. Traynor, Karen H. Miga, Miten Jain, Winston Timp, Adam M. Phillippy, Mark Chaisson, Fritz J. Sedlazeck, Cornelis Blauwendraat, Benedict Paten

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  20. 20
    Scalable Nanopore sequencing of human genomes provides a comprehensive view of haplotype-resolved variation and methylation

    Scalable Nanopore sequencing of human genomes provides a comprehensive view of haplotype-resolved variation and methylation за авторством Mikhail Kolmogorov, Kimberley J. Billingsley, Mira Mastoras, Melissa Meredith, Jean Monlong, Ryan Lorig-Roach, Mobin Asri, Pilar Álvarez Jerez, Laksh Malik, Ramita Dewan, Xylena Reed, Rylee M. Genner, Kensuke Daida, Sairam Behera, Kishwar Shafin, Trevor Pesout, Jeshuwin Prabakaran, P. Carnevali, Jianzhi Yang, Arang Rhie, Sonja W. Scholz, Bryan J. Traynor, Karen H. Miga, Miten Jain, Winston Timp, Adam M. Phillippy, Mark Chaisson, Fritz J. Sedlazeck, Cornelis Blauwendraat, Benedict Paten

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:

Інструменти для пошуку: