Результати пошуку - Leonardo Collado‐Torres

Уточнити результати
  1. 1
    recount workflow: Accessing over 70,000 human RNA-seq samples with Bioconductor

    recount workflow: Accessing over 70,000 human RNA-seq samples with Bioconductor за авторством Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Andrew E. Jaffe

    Опубліковано 2017
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  2. 2
    Improving the value of public RNA-seq expression data by phenotype prediction

    Improving the value of public RNA-seq expression data by phenotype prediction за авторством Shannon Ellis, Leonardo Collado‐Torres, Andrew E. Jaffe, Jeffrey T. Leek

    Опубліковано 2018
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  3. 3
    Interspecies interactions that result in<i>Bacillus subtilis</i>forming biofilms are mediated mainly by members of its own genus

    Interspecies interactions that result in<i>Bacillus subtilis</i>forming biofilms are mediated mainly by members of its own genus за авторством Elizabeth A. Shank, Vanja Klepac‐Ceraj, Leonardo Collado‐Torres, Gordon E. Powers, Richard Losick, Roberto Kolter

    Опубліковано 2011
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  4. 4
    SynGAP isoforms differentially regulate synaptic plasticity and dendritic development

    SynGAP isoforms differentially regulate synaptic plasticity and dendritic development за авторством Yoichi Araki, Ingie Hong, Timothy R. Gamache, Shaowen Ju, Leonardo Collado‐Torres, Joo Heon Shin, Richard L. Huganir

    Опубліковано 2020
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  5. 5
    Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets

    Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets за авторством Sean K. Maden, Sang Ho Kwon, Louise A. Huuki-Myers, Leonardo Collado‐Torres, Stephanie C. Hicks, Kristen R. Maynard

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  6. 6
    Rail-RNA: scalable analysis of RNA-seq splicing and coverage

    Rail-RNA: scalable analysis of RNA-seq splicing and coverage за авторством Abhinav Nellore, Leonardo Collado‐Torres, Andrew E. Jaffe, José Alquicira‐Hernandez, Christopher Wilks, Jacob Pritt, James T. Morton, Jeffrey T. Leek, Ben Langmead

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  7. 7
    Reproducible RNA-seq analysis using recount2

    Reproducible RNA-seq analysis using recount2 за авторством Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Kai Kammers, Shannon Ellis, Margaret A. Taub, Kasper D. Hansen, Andrew E. Jaffe, Ben Langmead, Jeffrey T. Leek

    Опубліковано 2017
    Отримати повний текст
    Carta
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  8. 8
    Flexible expressed region analysis for RNA-seq with<tt>derfinder</tt>

    Flexible expressed region analysis for RNA-seq with<tt>derfinder</tt> за авторством Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Alyssa C. Frazee, Christopher Wilks, Michael I. Love, Ben Langmead, Rafael A. Irizarry, Jeffrey T. Leek, Andrew E. Jaffe

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  9. 9
    SpatialExperiment: infrastructure for spatially-resolved transcriptomics data in R using Bioconductor

    SpatialExperiment: infrastructure for spatially-resolved transcriptomics data in R using Bioconductor за авторством Dario Righelli, Lukas M. Weber, Helena L. Crowell, Brenda Pardo, Leonardo Collado‐Torres, Shila Ghazanfar, Aaron T. L. Lun, Stephanie C. Hicks, Davide Risso

    Опубліковано 2022
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  10. 10
    spatialLIBD: an R/Bioconductor package to visualize spatially-resolved transcriptomics data

    spatialLIBD: an R/Bioconductor package to visualize spatially-resolved transcriptomics data за авторством Brenda Pardo, Abby Spangler, Lukas M. Weber, Stephanie C. Page, Stephanie C. Hicks, Andrew E. Jaffe, Keri Martinowich, Kristen R. Maynard, Leonardo Collado‐Torres

    Опубліковано 2022
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  11. 11
    Human splicing diversity and the extent of unannotated splice junctions across human RNA-seq samples on the Sequence Read Archive

    Human splicing diversity and the extent of unannotated splice junctions across human RNA-seq samples on the Sequence Read Archive за авторством Abhinav Nellore, Andrew E. Jaffe, Jean‐Philippe Fortin, José Alquicira‐Hernandez, Leonardo Collado‐Torres, Siruo Wang, Robert A. Phillips, Nishika Karbhari, Kasper D. Hansen, Ben Langmead, Jeffrey T. Leek

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  12. 12
    Comprehensive assessment of multiple biases in small RNA sequencing reveals significant differences in the performance of widely used methods

    Comprehensive assessment of multiple biases in small RNA sequencing reveals significant differences in the performance of widely used methods за авторством Carrie Wright, Anandita Rajpurohit, Emily E. Burke, Courtney Williams, Leonardo Collado‐Torres, Martha Kimos, Nicholas J. Brandon, A.J. Cross, Andrew E. Jaffe, Daniel R. Weinberger, Joo Heon Shin

    Опубліковано 2019
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  13. 13
    Developmental regulation of human cortex transcription and its clinical relevance at single base resolution

    Developmental regulation of human cortex transcription and its clinical relevance at single base resolution за авторством Andrew E. Jaffe, Jooheon Shin, Leonardo Collado‐Torres, Jeffrey T. Leek, Ran Tao, Chao Li, Yuan Gao, Yankai Jia, Brady J. Maher, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Daniel R. Weinberger

    Опубліковано 2014
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  14. 14
    Altered expression of histamine signaling genes in autism spectrum disorder

    Altered expression of histamine signaling genes in autism spectrum disorder за авторством Carrie Wright, Joo Heon Shin, Anandita Rajpurohit, Amy Deep‐Soboslay, Leonardo Collado‐Torres, Nicholas J. Brandon, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Andrew E. Jaffe, A.J. Cross, Daniel R. Weinberger

    Опубліковано 2017
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  15. 15
    Large-scale transcriptomic analyses of major depressive disorder reveal convergent dysregulation of synaptic pathways in excitatory neurons

    Large-scale transcriptomic analyses of major depressive disorder reveal convergent dysregulation of synaptic pathways in excitatory neurons за авторством Fernando S. Goes, Leonardo Collado‐Torres, Peter P. Zandi, Louise A. Huuki-Myers, Ran Tao, Andrew E. Jaffe, Geo Pertea, Joo Heon Shin, Daniel R. Weinberger, Joel E. Kleinman, Thomas M. Hyde

    Опубліковано 2025
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  16. 16
    Integrated DNA methylation and gene expression profiling across multiple brain regions implicate novel genes in Alzheimer’s disease

    Integrated DNA methylation and gene expression profiling across multiple brain regions implicate novel genes in Alzheimer’s disease за авторством Stephen A. Semick, Rahul Bharadwaj, Leonardo Collado‐Torres, Ran Tao, Joo Heon Shin, Amy Deep‐Soboslay, James R. Weiss, Daniel R. Weinberger, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Andrew E. Jaffe, Venkata S. Mattay

    Опубліковано 2019
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  17. 17
    Incomplete annotation has a disproportionate impact on our understanding of Mendelian and complex neurogenetic disorders

    Incomplete annotation has a disproportionate impact on our understanding of Mendelian and complex neurogenetic disorders за авторством David Zhang, Sebastian Guelfi, Sonia García-Ruiz, Beatrice Costa, Regina H. Reynolds, Karishma D’Sa, Wenfei Liu, Thomas Courtin, Amy Peterson, Andrew E. Jaffe, John Hardy, Juan A. Botía, Leonardo Collado‐Torres, Mina Ryten

    Опубліковано 2020
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  18. 18
    Divergent neuronal DNA methylation patterns across human cortical development reveal critical periods and a unique role of CpH methylation

    Divergent neuronal DNA methylation patterns across human cortical development reveal critical periods and a unique role of CpH methylation за авторством Amanda J. Price, Leonardo Collado‐Torres, Nikolay A. Ivanov, Wei Xia, Emily E. Burke, Joo Heon Shin, Ran Tao, Liang Ma, Yankai Jia, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Daniel R. Weinberger, Andrew E. Jaffe

    Опубліковано 2019
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  19. 19
    recount3: summaries and queries for large-scale RNA-seq expression and splicing

    recount3: summaries and queries for large-scale RNA-seq expression and splicing за авторством Christopher Wilks, Shijie Zheng, Feng Yong Chen, Rone Charles, Brad Solomon, Jonathan P. Ling, Eddie L. Imada, David Zhang, Lance Joseph, Jeffrey T. Leek, Andrew E. Jaffe, Abhinav Nellore, Leonardo Collado‐Torres, Kasper D. Hansen, Ben Langmead

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  20. 20
    Benchmark of cellular deconvolution methods using a multi-assay dataset from postmortem human prefrontal cortex

    Benchmark of cellular deconvolution methods using a multi-assay dataset from postmortem human prefrontal cortex за авторством Louise A. Huuki-Myers, Kelsey D. Montgomery, Sang Ho Kwon, Sophia Cinquemani, Nicholas J. Eagles, Daianna González‐Padilla, Sean K. Maden, Joel E. Kleinman, Thomas M. Hyde, Stephanie C. Hicks, Kristen R. Maynard, Leonardo Collado‐Torres

    Опубліковано 2025
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:

Інструменти для пошуку: