লেখক অনুসন্ধানের ফলাফল :: APM

1

recount workflow: Accessing over 70,000 human RNA-seq samples with Bioconductor অনুযায়ী Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Andrew E. Jaffe

প্রকাশিত 2017

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Pré-impressão

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
2

Improving the value of public RNA-seq expression data by phenotype prediction অনুযায়ী Shannon Ellis, Leonardo Collado‐Torres, Andrew E. Jaffe, Jeffrey T. Leek

প্রকাশিত 2018

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
3

Interspecies interactions that result in<i>Bacillus subtilis</i>forming biofilms are mediated mainly by members of its own genus অনুযায়ী Elizabeth A. Shank, Vanja Klepac‐Ceraj, Leonardo Collado‐Torres, Gordon E. Powers, Richard Losick, Roberto Kolter

প্রকাশিত 2011

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
4

SynGAP isoforms differentially regulate synaptic plasticity and dendritic development অনুযায়ী Yoichi Araki, Ingie Hong, Timothy R. Gamache, Shaowen Ju, Leonardo Collado‐Torres, Joo Heon Shin, Richard L. Huganir

প্রকাশিত 2020

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
5

Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets অনুযায়ী Sean K. Maden, Sang Ho Kwon, Louise A. Huuki-Myers, Leonardo Collado‐Torres, Stephanie C. Hicks, Kristen R. Maynard

প্রকাশিত 2023

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Revisão

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
6

Rail-RNA: scalable analysis of RNA-seq splicing and coverage অনুযায়ী Abhinav Nellore, Leonardo Collado‐Torres, Andrew E. Jaffe, José Alquicira‐Hernandez, Christopher Wilks, Jacob Pritt, James T. Morton, Jeffrey T. Leek, Ben Langmead

প্রকাশিত 2016

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
7

Reproducible RNA-seq analysis using recount2 অনুযায়ী Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Kai Kammers, Shannon Ellis, Margaret A. Taub, Kasper D. Hansen, Andrew E. Jaffe, Ben Langmead, Jeffrey T. Leek

প্রকাশিত 2017

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Carta

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
8

Flexible expressed region analysis for RNA-seq with<tt>derfinder</tt> অনুযায়ী Leonardo Collado‐Torres, Abhinav Nellore, Alyssa C. Frazee, Christopher Wilks, Michael I. Love, Ben Langmead, Rafael A. Irizarry, Jeffrey T. Leek, Andrew E. Jaffe

প্রকাশিত 2016

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
9

SpatialExperiment: infrastructure for spatially-resolved transcriptomics data in R using Bioconductor অনুযায়ী Dario Righelli, Lukas M. Weber, Helena L. Crowell, Brenda Pardo, Leonardo Collado‐Torres, Shila Ghazanfar, Aaron T. L. Lun, Stephanie C. Hicks, Davide Risso

প্রকাশিত 2022

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
10

spatialLIBD: an R/Bioconductor package to visualize spatially-resolved transcriptomics data অনুযায়ী Brenda Pardo, Abby Spangler, Lukas M. Weber, Stephanie C. Page, Stephanie C. Hicks, Andrew E. Jaffe, Keri Martinowich, Kristen R. Maynard, Leonardo Collado‐Torres

প্রকাশিত 2022

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
11

Human splicing diversity and the extent of unannotated splice junctions across human RNA-seq samples on the Sequence Read Archive অনুযায়ী Abhinav Nellore, Andrew E. Jaffe, Jean‐Philippe Fortin, José Alquicira‐Hernandez, Leonardo Collado‐Torres, Siruo Wang, Robert A. Phillips, Nishika Karbhari, Kasper D. Hansen, Ben Langmead, Jeffrey T. Leek

প্রকাশিত 2016

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
12

Comprehensive assessment of multiple biases in small RNA sequencing reveals significant differences in the performance of widely used methods অনুযায়ী Carrie Wright, Anandita Rajpurohit, Emily E. Burke, Courtney Williams, Leonardo Collado‐Torres, Martha Kimos, Nicholas J. Brandon, A.J. Cross, Andrew E. Jaffe, Daniel R. Weinberger, Joo Heon Shin

প্রকাশিত 2019

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
13

Developmental regulation of human cortex transcription and its clinical relevance at single base resolution অনুযায়ী Andrew E. Jaffe, Jooheon Shin, Leonardo Collado‐Torres, Jeffrey T. Leek, Ran Tao, Chao Li, Yuan Gao, Yankai Jia, Brady J. Maher, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Daniel R. Weinberger

প্রকাশিত 2014

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
14

Altered expression of histamine signaling genes in autism spectrum disorder অনুযায়ী Carrie Wright, Joo Heon Shin, Anandita Rajpurohit, Amy Deep‐Soboslay, Leonardo Collado‐Torres, Nicholas J. Brandon, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Andrew E. Jaffe, A.J. Cross, Daniel R. Weinberger

প্রকাশিত 2017

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Revisão

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
15

Large-scale transcriptomic analyses of major depressive disorder reveal convergent dysregulation of synaptic pathways in excitatory neurons অনুযায়ী Fernando S. Goes, Leonardo Collado‐Torres, Peter P. Zandi, Louise A. Huuki-Myers, Ran Tao, Andrew E. Jaffe, Geo Pertea, Joo Heon Shin, Daniel R. Weinberger, Joel E. Kleinman, Thomas M. Hyde

প্রকাশিত 2025

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
16

Integrated DNA methylation and gene expression profiling across multiple brain regions implicate novel genes in Alzheimer’s disease অনুযায়ী Stephen A. Semick, Rahul Bharadwaj, Leonardo Collado‐Torres, Ran Tao, Joo Heon Shin, Amy Deep‐Soboslay, James R. Weiss, Daniel R. Weinberger, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Andrew E. Jaffe, Venkata S. Mattay

প্রকাশিত 2019

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
17

Incomplete annotation has a disproportionate impact on our understanding of Mendelian and complex neurogenetic disorders অনুযায়ী David Zhang, Sebastian Guelfi, Sonia García-Ruiz, Beatrice Costa, Regina H. Reynolds, Karishma D’Sa, Wenfei Liu, Thomas Courtin, Amy Peterson, Andrew E. Jaffe, John Hardy, Juan A. Botía, Leonardo Collado‐Torres, Mina Ryten

প্রকাশিত 2020

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
18

Divergent neuronal DNA methylation patterns across human cortical development reveal critical periods and a unique role of CpH methylation অনুযায়ী Amanda J. Price, Leonardo Collado‐Torres, Nikolay A. Ivanov, Wei Xia, Emily E. Burke, Joo Heon Shin, Ran Tao, Liang Ma, Yankai Jia, Thomas M. Hyde, Joel E. Kleinman, Daniel R. Weinberger, Andrew E. Jaffe

প্রকাশিত 2019

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
19

recount3: summaries and queries for large-scale RNA-seq expression and splicing অনুযায়ী Christopher Wilks, Shijie Zheng, Feng Yong Chen, Rone Charles, Brad Solomon, Jonathan P. Ling, Eddie L. Imada, David Zhang, Lance Joseph, Jeffrey T. Leek, Andrew E. Jaffe, Abhinav Nellore, Leonardo Collado‐Torres, Kasper D. Hansen, Ben Langmead

প্রকাশিত 2021

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন:
20

Benchmark of cellular deconvolution methods using a multi-assay dataset from postmortem human prefrontal cortex অনুযায়ী Louise A. Huuki-Myers, Kelsey D. Montgomery, Sang Ho Kwon, Sophia Cinquemani, Nicholas J. Eagles, Daianna González‐Padilla, Sean K. Maden, Joel E. Kleinman, Thomas M. Hyde, Stephanie C. Hicks, Kristen R. Maynard, Leonardo Collado‐Torres

প্রকাশিত 2025

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য
Artigo

তালিকাভুক্ত করুন

সংরক্ষণ করুন: