Результати пошуку - Jeffrey J. Gray

Уточнити результати
  1. 1
    The RosettaDock server for local protein-protein docking

    The RosettaDock server for local protein-protein docking за авторством Sergey Lyskov, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2008
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  2. 2
    SnugDock: Paratope Structural Optimization during Antibody-Antigen Docking Compensates for Errors in Antibody Homology Models

    SnugDock: Paratope Structural Optimization during Antibody-Antigen Docking Compensates for Errors in Antibody Homology Models за авторством Aroop Sircar, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2010
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  3. 3
    Conformer Selection and Induced Fit in Flexible Backbone Protein–Protein Docking Using Computational and NMR Ensembles

    Conformer Selection and Induced Fit in Flexible Backbone Protein–Protein Docking Using Computational and NMR Ensembles за авторством Sidhartha Chaudhury, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2008
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  4. 4
    Shape complementarity and hydrogen bond preferences in protein–protein interfaces: implications for antibody modeling and protein–protein docking

    Shape complementarity and hydrogen bond preferences in protein–protein interfaces: implications for antibody modeling and protein–protein docking за авторством Daisuke Kuroda, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  5. 5
    Pushing the Backbone in Protein-Protein Docking

    Pushing the Backbone in Protein-Protein Docking за авторством Daisuke Kuroda, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  6. 6
    Advances to tackle backbone flexibility in protein docking

    Advances to tackle backbone flexibility in protein docking за авторством Ameya Harmalkar, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2020
    Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  7. 7
    AI models for protein design are driving antibody engineering

    AI models for protein design are driving antibody engineering за авторством Michael Chungyoun, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2023
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Revisão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  8. 8
    Allosteric Communication Occurs via Networks of Tertiary and Quaternary Motions in Proteins

    Allosteric Communication Occurs via Networks of Tertiary and Quaternary Motions in Proteins за авторством Michael D. Daily, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2009
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  9. 9
    Rapid Calculation of Protein pKa Values Using Rosetta

    Rapid Calculation of Protein pKa Values Using Rosetta за авторством Krishna Praneeth Kilambi, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2012
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  10. 10
    Fast, accurate antibody structure prediction from deep learning on massive set of natural antibodies

    Fast, accurate antibody structure prediction from deep learning on massive set of natural antibodies за авторством Jeffrey A. Ruffolo, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2022
    Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  11. 11
    What has AlphaFold3 learned about antibody and nanobody docking, and what remains unsolved?

    What has AlphaFold3 learned about antibody and nanobody docking, and what remains unsolved? за авторством Fatima N. Hitawala, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2024
    Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  12. 12
    PyRosetta: a script-based interface for implementing molecular modeling algorithms using Rosetta

    PyRosetta: a script-based interface for implementing molecular modeling algorithms using Rosetta за авторством Sidhartha Chaudhury, Sergey Lyskov, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2010
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  13. 13
    Improved prediction of antibody V<sub>L</sub>–V<sub>H</sub>orientation

    Improved prediction of antibody V<sub>L</sub>–V<sub>H</sub>orientation за авторством Nicholas Marze, Sergey Lyskov, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2016
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  14. 14
    Reliable protein-protein docking with AlphaFold, Rosetta, and replica-exchange

    Reliable protein-protein docking with AlphaFold, Rosetta, and replica-exchange за авторством Ameya Harmalkar, Sergey Lyskov, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2024
    Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  15. 15
    Reliable protein-protein docking with AlphaFold, Rosetta, and replica-exchange

    Reliable protein-protein docking with AlphaFold, Rosetta, and replica-exchange за авторством Ameya Harmalkar, Sergey Lyskov, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2025
    Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  16. 16
    RosettaAntibody: antibody variable region homology modeling server

    RosettaAntibody: antibody variable region homology modeling server за авторством Amit Sircar, Eui Tae Kim, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2009
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  17. 17
    Deciphering antibody affinity maturation with language models and weakly supervised learning

    Deciphering antibody affinity maturation with language models and weakly supervised learning за авторством Jeffrey A. Ruffolo, Jeffrey J. Gray, Jeremias Sulam

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  18. 18
    Antibody structure prediction using interpretable deep learning

    Antibody structure prediction using interpretable deep learning за авторством Jeffrey A. Ruffolo, Jeremias Sulam, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2021
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  19. 19
    FLAb: Benchmarking deep learning methods for antibody fitness prediction

    FLAb: Benchmarking deep learning methods for antibody fitness prediction за авторством Michael Chungyoun, Jeffrey A. Ruffolo, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2024
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Pré-impressão
    Додати у Вибране
    Збережено в:
  20. 20
    The Origin of CDR H3 Structural Diversity

    The Origin of CDR H3 Structural Diversity за авторством Brian D. Weitzner, Roland L. Dunbrack, Jeffrey J. Gray

    Опубліковано 2015
    Отримати повний текст Отримати повний текст
    Artigo
    Додати у Вибране
    Збережено в:

Інструменти для пошуку: