Որոնման արդյունքները - Davis J. McCarthy

Հստակեցնել արդյունքները
  1. 1
    Testing significance relative to a fold-change threshold is a TREAT

    Testing significance relative to a fold-change threshold is a TREAT ‌ Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    Հրապարակվել է 2009
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  2. 2
    A comparison of marker gene selection methods for single-cell RNA sequencing data

    A comparison of marker gene selection methods for single-cell RNA sequencing data ‌ Jeffrey M. Pullin, Davis J. McCarthy

    Հրապարակվել է 2024
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  3. 3
    Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference

    Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference ‌ Yuanhua Huang, Davis J. McCarthy, Oliver Stegle

    Հրապարակվել է 2019
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  4. 4
    Differential expression analysis of multifactor RNA-Seq experiments with respect to biological variation

    Differential expression analysis of multifactor RNA-Seq experiments with respect to biological variation ‌ Davis J. McCarthy, Yunshun Chen, Gordon K. Smyth

    Հրապարակվել է 2012
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  5. 5
    <tt>edgeR</tt>: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data

    <tt>edgeR</tt>: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data ‌ Mark D. Robinson, Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    Հրապարակվել է 2009
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  6. 6
    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data

    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data ‌ Aaron T. L. Lun, Davis J. McCarthy, John C. Marioni

    Հրապարակվել է 2016
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Pré-impressão
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  7. 7
    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor

    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor ‌ Aaron T. L. Lun, Davis J. McCarthy, John C. Marioni

    Հրապարակվել է 2016
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Pré-impressão
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  8. 8
    Detecting Differential Expression in RNA-sequence Data Using Quasi-likelihood with Shrunken Dispersion Estimates

    Detecting Differential Expression in RNA-sequence Data Using Quasi-likelihood with Shrunken Dispersion Estimates ‌ Steven P. Lund, Dan Nettleton, Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    Հրապարակվել է 2012
    Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  9. 9
    Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R

    Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R ‌ Davis J. McCarthy, Kieran R. Campbell, Aaron T. L. Lun, Quin F. Wills

    Հրապարակվել է 2016
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  10. 10
    f-scLVM: scalable and versatile factor analysis for single-cell RNA-seq

    f-scLVM: scalable and versatile factor analysis for single-cell RNA-seq ‌ Florian Buettner, Ploy N. Pratanwanich, Davis J. McCarthy, John C. Marioni, Oliver Stegle

    Հրապարակվել է 2017
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  11. 11
    Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies

    Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies ‌ Anna Cuomo, Giordano Alvari, Christina B. Azodi, Davis J. McCarthy, Marc Jan Bonder

    Հրապարակվել է 2021
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  12. 12
    SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset

    SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset ‌ Ruqian Lyu, Annika Vannan, Jonathan A. Kropski, Nicholas E. Banovich, Davis J. McCarthy

    Հրապարակվել է 2025
    Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Pré-impressão
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  13. 13
    Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R and Bioconductor

    Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R and Bioconductor ‌ Simon Anders, Davis J. McCarthy, Yunshun Chen, Michał Okoniewski, Gordon K. Smyth, Wolfgang Huber, Mark D. Robinson

    Հրապարակվել է 2013
    Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  14. 14
    Choice of transcripts and software has a large effect on variant annotation

    Choice of transcripts and software has a large effect on variant annotation ‌ Davis J. McCarthy, Peter Humburg, Alexander Kanapin, Manuel A. Rivas, Kyle J. Gaulton, Jean‐Baptiste Cazier, Peter Donnelly

    Հրապարակվել է 2014
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  15. 15
    Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data

    Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data ‌ Tomislav Ilicic, Jong Kim, Aleksandra A. Kolodziejczyk, Frederik Otzen Bagger, Davis J. McCarthy, John C. Marioni, Sarah A. Teichmann

    Հրապարակվել է 2016
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  16. 16
    Combined single-cell profiling of expression and DNA methylation reveals splicing regulation and heterogeneity

    Combined single-cell profiling of expression and DNA methylation reveals splicing regulation and heterogeneity ‌ Stephanie M. Linker, Lara Urban, Stephen J. Clark, Mariya Chhatriwala, Shradha Amatya, Davis J. McCarthy, Ingo Ebersberger, Ludovic Vallier, Wolf Reik, Oliver Stegle, Marc Jan Bonder

    Հրապարակվել է 2019
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  17. 17
    Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods

    Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods ‌ Drew Neavin, Anne Senabouth, Himanshi Arora, Jimmy Tsz Hang Lee, Aida Ripoll-Cladellas, Lude Franke, Shyam Prabhakar, Chun Ye, Davis J. McCarthy, Marta Melé, Martin Hemberg, Joseph E. Powell

    Հրապարակվել է 2024
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  18. 18
    Visualization of Biomedical Data

    Visualization of Biomedical Data ‌ Séan O’Donoghue, Benedetta F. Baldi, Susan J. Clark, Aaron E. Darling, James M. Hogan, Sandeep Kaur, Lena Maier‐Hein, Davis J. McCarthy, William J. Moore, Esther Stenau, Jason R. Swedlow, Jenny Vuong, James B Procter

    Հրապարակվել է 2018
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  19. 19
    Method to Synchronize Cell Cycle of Human Pluripotent Stem Cells without Affecting Their Fundamental Characteristics

    Method to Synchronize Cell Cycle of Human Pluripotent Stem Cells without Affecting Their Fundamental Characteristics ‌ Loukia Yiangou, Rodrigo A. Grandy, Carola Maria Morell, Rute A. Tomaz, Anna Osnato, Juned Kadiwala, Daniele Muraro, José Garcia‐Bernardo, Shota Nakanoh, William G. Bernard, Daniel Ortmann, Davis J. McCarthy, Ingrid Simonic, Sanjay Sinha, Ludovic Vallier

    Հրապարակվել է 2018
    Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Artigo
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:
  20. 20
    Cell type-specific and disease-associated eQTL in the human lung

    Cell type-specific and disease-associated eQTL in the human lung ‌ Heini M. Natri, Christina B. Azodi, Lance Peter, Chase J. Taylor, Sagrika Chugh, Robert Kendle, Mei-I Chung, David K. Flaherty, Brittany K. Matlock, Carla L. Calvi, Timothy S. Blackwell, Lorraine B. Ware, Matthew Bacchetta, Rajat Walia, Ciara M. Shaver, Jonathan A. Kropski, Davis J. McCarthy, Nicholas E. Banovich

    Հրապարակվել է 2023
    Ստացեք ամբողջական տեքստը Ստացեք ամբողջական տեքստը
    Pré-impressão
    Պահել ցուցակում
    Պահպանված է:

Որոնման գործիքներ: