نتائج البحث - Davis J. McCarthy

تنقيح النتائج
  1. 1
    Testing significance relative to a fold-change threshold is a TREAT

    Testing significance relative to a fold-change threshold is a TREAT حسب Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    منشور في 2009
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  2. 2
    A comparison of marker gene selection methods for single-cell RNA sequencing data

    A comparison of marker gene selection methods for single-cell RNA sequencing data حسب Jeffrey M. Pullin, Davis J. McCarthy

    منشور في 2024
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  3. 3
    Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference

    Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference حسب Yuanhua Huang, Davis J. McCarthy, Oliver Stegle

    منشور في 2019
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  4. 4
    Differential expression analysis of multifactor RNA-Seq experiments with respect to biological variation

    Differential expression analysis of multifactor RNA-Seq experiments with respect to biological variation حسب Davis J. McCarthy, Yunshun Chen, Gordon K. Smyth

    منشور في 2012
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  5. 5
    <tt>edgeR</tt>: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data

    <tt>edgeR</tt>: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data حسب Mark D. Robinson, Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    منشور في 2009
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  6. 6
    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data

    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data حسب Aaron T. L. Lun, Davis J. McCarthy, John C. Marioni

    منشور في 2016
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Pré-impressão
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  7. 7
    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor

    A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor حسب Aaron T. L. Lun, Davis J. McCarthy, John C. Marioni

    منشور في 2016
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Pré-impressão
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  8. 8
    Detecting Differential Expression in RNA-sequence Data Using Quasi-likelihood with Shrunken Dispersion Estimates

    Detecting Differential Expression in RNA-sequence Data Using Quasi-likelihood with Shrunken Dispersion Estimates حسب Steven P. Lund, Dan Nettleton, Davis J. McCarthy, Gordon K. Smyth

    منشور في 2012
    احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  9. 9
    Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R

    Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R حسب Davis J. McCarthy, Kieran R. Campbell, Aaron T. L. Lun, Quin F. Wills

    منشور في 2016
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  10. 10
    f-scLVM: scalable and versatile factor analysis for single-cell RNA-seq

    f-scLVM: scalable and versatile factor analysis for single-cell RNA-seq حسب Florian Buettner, Ploy N. Pratanwanich, Davis J. McCarthy, John C. Marioni, Oliver Stegle

    منشور في 2017
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  11. 11
    Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies

    Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies حسب Anna Cuomo, Giordano Alvari, Christina B. Azodi, Davis J. McCarthy, Marc Jan Bonder

    منشور في 2021
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  12. 12
    SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset

    SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset حسب Ruqian Lyu, Annika Vannan, Jonathan A. Kropski, Nicholas E. Banovich, Davis J. McCarthy

    منشور في 2025
    احصل على النص الكامل
    Pré-impressão
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  13. 13
    Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R and Bioconductor

    Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R and Bioconductor حسب Simon Anders, Davis J. McCarthy, Yunshun Chen, Michał Okoniewski, Gordon K. Smyth, Wolfgang Huber, Mark D. Robinson

    منشور في 2013
    احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  14. 14
    Choice of transcripts and software has a large effect on variant annotation

    Choice of transcripts and software has a large effect on variant annotation حسب Davis J. McCarthy, Peter Humburg, Alexander Kanapin, Manuel A. Rivas, Kyle J. Gaulton, Jean‐Baptiste Cazier, Peter Donnelly

    منشور في 2014
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  15. 15
    Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data

    Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data حسب Tomislav Ilicic, Jong Kim, Aleksandra A. Kolodziejczyk, Frederik Otzen Bagger, Davis J. McCarthy, John C. Marioni, Sarah A. Teichmann

    منشور في 2016
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  16. 16
    Combined single-cell profiling of expression and DNA methylation reveals splicing regulation and heterogeneity

    Combined single-cell profiling of expression and DNA methylation reveals splicing regulation and heterogeneity حسب Stephanie M. Linker, Lara Urban, Stephen J. Clark, Mariya Chhatriwala, Shradha Amatya, Davis J. McCarthy, Ingo Ebersberger, Ludovic Vallier, Wolf Reik, Oliver Stegle, Marc Jan Bonder

    منشور في 2019
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  17. 17
    Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods

    Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods حسب Drew Neavin, Anne Senabouth, Himanshi Arora, Jimmy Tsz Hang Lee, Aida Ripoll-Cladellas, Lude Franke, Shyam Prabhakar, Chun Ye, Davis J. McCarthy, Marta Melé, Martin Hemberg, Joseph E. Powell

    منشور في 2024
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  18. 18
    Visualization of Biomedical Data

    Visualization of Biomedical Data حسب Séan O’Donoghue, Benedetta F. Baldi, Susan J. Clark, Aaron E. Darling, James M. Hogan, Sandeep Kaur, Lena Maier‐Hein, Davis J. McCarthy, William J. Moore, Esther Stenau, Jason R. Swedlow, Jenny Vuong, James B Procter

    منشور في 2018
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  19. 19
    Method to Synchronize Cell Cycle of Human Pluripotent Stem Cells without Affecting Their Fundamental Characteristics

    Method to Synchronize Cell Cycle of Human Pluripotent Stem Cells without Affecting Their Fundamental Characteristics حسب Loukia Yiangou, Rodrigo A. Grandy, Carola Maria Morell, Rute A. Tomaz, Anna Osnato, Juned Kadiwala, Daniele Muraro, José Garcia‐Bernardo, Shota Nakanoh, William G. Bernard, Daniel Ortmann, Davis J. McCarthy, Ingrid Simonic, Sanjay Sinha, Ludovic Vallier

    منشور في 2018
    احصل على النص الكامل
    Artigo
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:
  20. 20
    Cell type-specific and disease-associated eQTL in the human lung

    Cell type-specific and disease-associated eQTL in the human lung حسب Heini M. Natri, Christina B. Azodi, Lance Peter, Chase J. Taylor, Sagrika Chugh, Robert Kendle, Mei-I Chung, David K. Flaherty, Brittany K. Matlock, Carla L. Calvi, Timothy S. Blackwell, Lorraine B. Ware, Matthew Bacchetta, Rajat Walia, Ciara M. Shaver, Jonathan A. Kropski, Davis J. McCarthy, Nicholas E. Banovich

    منشور في 2023
    احصل على النص الكامل احصل على النص الكامل
    Pré-impressão
    أضف إلى المفضلة
    محفوظ في:

أدوات البحث: