Výsledky vyhledávání - Carlos Simmerling

Upřesnit hledání
  1. 1
    Targeting structural flexibility in HIV-1 protease inhibitor binding

    Targeting structural flexibility in HIV-1 protease inhibitor binding Autor Viktor Horn̆ák, Carlos Simmerling

    Vydáno 2006
    Získat plný text
    Revisão
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  2. 2
    Fast Pairwise Approximation of Solvent Accessible Surface Area for Implicit Solvent Simulations of Proteins on CPUs and GPUs

    Fast Pairwise Approximation of Solvent Accessible Surface Area for Implicit Solvent Simulations of Proteins on CPUs and GPUs Autor He Huang, Carlos Simmerling

    Vydáno 2018
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  3. 3
    Solution Structure of HIV-1 Protease Flaps Probed by Comparison of Molecular Dynamics Simulation Ensembles and EPR Experiments

    Solution Structure of HIV-1 Protease Flaps Probed by Comparison of Molecular Dynamics Simulation Ensembles and EPR Experiments Autor Fangyu Ding, Melinda Layten, Carlos Simmerling

    Vydáno 2008
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  4. 4
    Coupling of Replica Exchange Simulations to a Non-Boltzmann Structure Reservoir

    Coupling of Replica Exchange Simulations to a Non-Boltzmann Structure Reservoir Autor Adrián E. Roitberg, Asim Okur, Carlos Simmerling

    Vydáno 2007
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  5. 5
    Protein storytelling through physics

    Protein storytelling through physics Autor Emiliano Brini, Carlos Simmerling, Ken A. Dill

    Vydáno 2020
    Získat plný text
    Revisão
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  6. 6
    Modified Replica Exchange Simulation Methods for Local Structure Refinement

    Modified Replica Exchange Simulation Methods for Local Structure Refinement Autor Xiaolin Cheng, Guanglei Cui, Viktor Horn̆ák, Carlos Simmerling

    Vydáno 2005
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  7. 7
    HIV-1 Protease Flaps Spontaneously Close to the Correct Structure in Simulations Following Manual Placement of an Inhibitor into the Open State

    HIV-1 Protease Flaps Spontaneously Close to the Correct Structure in Simulations Following Manual Placement of an Inhibitor into the Open State Autor Viktor Horn̆ák, Asim Okur, Robert C. Rizzo, Carlos Simmerling

    Vydáno 2006
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  8. 8
    HIV-1 protease flaps spontaneously open and reclose in molecular dynamics simulations

    HIV-1 protease flaps spontaneously open and reclose in molecular dynamics simulations Autor Viktor Horn̆ák, Asim Okur, Robert C. Rizzo, Carlos Simmerling

    Vydáno 2006
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  9. 9
    Improved Generalized Born Solvent Model Parameters for Protein Simulations

    Improved Generalized Born Solvent Model Parameters for Protein Simulations Autor Thi Hong Hai Nguyen, Daniel R. Roe, Carlos Simmerling

    Vydáno 2013
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  10. 10
    A partial nudged elastic band implementation for use with large or explicitly solvated systems

    A partial nudged elastic band implementation for use with large or explicitly solvated systems Autor Christina Bergonzo, Arthur J. Campbell, Ross C. Walker, Carlos Simmerling

    Vydáno 2009
    Získat plný text Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  11. 11
    Advances in free-energy-based simulations of protein folding and ligand binding

    Advances in free-energy-based simulations of protein folding and ligand binding Autor Alberto Pérez, Joseph A. Morrone, Carlos Simmerling, Ken A. Dill

    Vydáno 2016
    Získat plný text
    Revisão
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  12. 12
    Refinement of Generalized Born Implicit Solvation Parameters for Nucleic Acids and Their Complexes with Proteins

    Refinement of Generalized Born Implicit Solvation Parameters for Nucleic Acids and Their Complexes with Proteins Autor Thi Hong Hai Nguyen, Alberto Pérez, Sherry Bermeo, Carlos Simmerling

    Vydáno 2015
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  13. 13
    Folding Simulations for Proteins with Diverse Topologies Are Accessible in Days with a Physics-Based Force Field and Implicit Solvent

    Folding Simulations for Proteins with Diverse Topologies Are Accessible in Days with a Physics-Based Force Field and Implicit Solvent Autor Thi Hong Hai Nguyen, James Maier, He Huang, Victoria Perrone, Carlos Simmerling

    Vydáno 2014
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  14. 14
    ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB

    ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB Autor James Maier, Carmenza Martinez, Koushik Kasavajhala, Lauren Wickstrom, Kevin Hauser, Carlos Simmerling

    Vydáno 2015
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  15. 15
    Comparison of multiple Amber force fields and development of improved protein backbone parameters

    Comparison of multiple Amber force fields and development of improved protein backbone parameters Autor Viktor Horn̆ák, Robert Abel, Asim Okur, Bentley Strockbine, Adrián E. Roitberg, Carlos Simmerling

    Vydáno 2006
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  16. 16
    Grid-Based Backbone Correction to the ff12SB Protein Force Field for Implicit-Solvent Simulations

    Grid-Based Backbone Correction to the ff12SB Protein Force Field for Implicit-Solvent Simulations Autor Alberto Pérez, Justin L. MacCallum, Emiliano Brini, Carlos Simmerling, Ken A. Dill

    Vydáno 2015
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  17. 17
    k-Means NANI: An Improved Clustering Algorithm for Molecular Dynamics Simulations

    k-Means NANI: An Improved Clustering Algorithm for Molecular Dynamics Simulations Autor Lexin Chen, Daniel R. Roe, Matthew Kochert, Carlos Simmerling, Ramón Alain Miranda‐Quintana

    Vydáno 2024
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  18. 18
    Generalized Born Model with a Simple, Robust Molecular Volume Correction

    Generalized Born Model with a Simple, Robust Molecular Volume Correction Autor John Mongan, Carlos Simmerling, J. Andrew McCammon, David A. Case, Alexey V. Onufriev

    Vydáno 2006
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  19. 19
    Drug Pressure Selected Mutations in HIV-1 Protease Alter Flap Conformations

    Drug Pressure Selected Mutations in HIV-1 Protease Alter Flap Conformations Autor Luis Galiano, Fangyu Ding, Angelo M. Veloro, Mandy E. Blackburn, Carlos Simmerling, Gail E. Fanucci

    Vydáno 2008
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  20. 20
    Dynamic Behavior of DNA Base Pairs Containing 8-Oxoguanine

    Dynamic Behavior of DNA Base Pairs Containing 8-Oxoguanine Autor Xiaolin Cheng, Catherine Kelso, Viktor Horn̆ák, Carlos de los Santos, Arthur P. Grollman, Carlos Simmerling

    Vydáno 2005
    Získat plný text
    Artigo
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:

Vyhledávací nástroje: