Résultats de la recherche - Brian A. Joughin

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    Multiplexed relative and absolute quantitative immunopeptidomics reveals MHC I repertoire alterations induced by CDK4/6 inhibition

    Multiplexed relative and absolute quantitative immunopeptidomics reveals MHC I repertoire alterations induced by CDK4/6 inhibition par Lauren Stopfer, Joshua M. Mesfin, Brian A. Joughin, Douglas A. Lauffenburger, Forest M. White

    Publié 2020
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  2. 2
    ROS and Oxidative Stress Are Elevated in Mitosis during Asynchronous Cell Cycle Progression and Are Exacerbated by Mitotic Arrest

    ROS and Oxidative Stress Are Elevated in Mitosis during Asynchronous Cell Cycle Progression and Are Exacerbated by Mitotic Arrest par Jesse C. Patterson, Brian A. Joughin, Bert van de Kooij, Daniel Lim, Douglas A. Lauffenburger, Michael B. Yaffe

    Publié 2019
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  3. 3
    Shank3 mutation in a mouse model of autism leads to changes in the S-nitroso-proteome and affects key proteins involved in vesicle release and synaptic function

    Shank3 mutation in a mouse model of autism leads to changes in the S-nitroso-proteome and affects key proteins involved in vesicle release and synaptic function par Haitham Amal, Boaz Barak, Vadiraja B. Bhat, Guanyu Gong, Brian A. Joughin, Xin Wang, John S. Wishnok, Guoping Feng, Steven R. Tannenbaum

    Publié 2018
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  4. 4
    DNA Repair Capacity in Multiple Pathways Predicts Chemoresistance in Glioblastoma Multiforme

    DNA Repair Capacity in Multiple Pathways Predicts Chemoresistance in Glioblastoma Multiforme par Zachary D. Nagel, Gaspar J. Kitange, Shiv K. Gupta, Brian A. Joughin, Isaac A. Chaim, Patrizia Mazzucato, Douglas A. Lauffenburger, Jann N. Sarkaria, Leona D. Samson

    Publié 2016
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  5. 5
    The injury response to DNA damage in live tumor cells promotes antitumor immunity

    The injury response to DNA damage in live tumor cells promotes antitumor immunity par Ganapathy Sriram, Lauren E. Milling, Jung-Kuei Chen, Yi Wen Kong, Brian A. Joughin, Wuhbet Abraham, Susanne Swartwout, Erika D. Handly, Darrell J. Irvine, Michael B. Yaffe

    Publié 2021
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  6. 6
    Quantitative Phospho-proteomics to Investigate the Polo-like Kinase 1-Dependent Phospho-proteome

    Quantitative Phospho-proteomics to Investigate the Polo-like Kinase 1-Dependent Phospho-proteome par Karin Grosstessner‐Hain, Björn Hegemann, Maria Novatchkova, Jonathan Rameseder, Brian A. Joughin, Otto Hudecz, Elisabeth Roitinger, Peter Pichler, Norbert Kraut, Michael B. Yaffe, Jan‐Michael Peters, Karl Mechtler

    Publié 2011
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  7. 7
    A genome-scale in vivo loss-of-function screen identifies <i>Phf6</i> as a lineage-specific regulator of leukemia cell growth

    A genome-scale in vivo loss-of-function screen identifies <i>Phf6</i> as a lineage-specific regulator of leukemia cell growth par Corbin E. Meacham, Lee N. Lawton, Yadira M. Soto-Feliciano, Justin R. Pritchard, Brian A. Joughin, Tobias Ehrenberger, Nina Fenouille, Johannes Zuber, Richard T. Williams, Richard A. Young, Michael T. Hemann

    Publié 2015
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  8. 8
    Biphasic JNK-Erk signaling separates the induction and maintenance of cell senescence after DNA damage induced by topoisomerase II inhibition

    Biphasic JNK-Erk signaling separates the induction and maintenance of cell senescence after DNA damage induced by topoisomerase II inhibition par Tatiana S. Netterfield, Gerard J. Ostheimer, Andrea R. Tentner, Brian A. Joughin, Alexandra M. Dakoyannis, Charvi D. Sharma, Peter K. Sorger, Kevin A. Janes, Douglas A. Lauffenburger, Michael B. Yaffe

    Publié 2023
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  9. 9
    Comprehensive substrate specificity profiling of the human Nek kinome reveals unexpected signaling outputs

    Comprehensive substrate specificity profiling of the human Nek kinome reveals unexpected signaling outputs par Bert van de Kooij, Pau Creixell, Anne van Vlimmeren, Brian A. Joughin, Chad J. Miller, Nasir Haider, Craig D. Simpson, Rune Linding, Vuk Stambolic, Benjamin E. Turk, Michael B. Yaffe

    Publié 2019
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  10. 10
    Proteogenomic Network Analysis of Context-Specific KRAS Signaling in Mouse-to-Human Cross-Species Translation

    Proteogenomic Network Analysis of Context-Specific KRAS Signaling in Mouse-to-Human Cross-Species Translation par Douglas K. Brubaker, João A. Paulo, Shikha Sheth, Emily J. Poulin, Olesja Popow, Brian A. Joughin, Samantha Dale Strasser, Alina Starchenko, Steven P. Gygi, Douglas A. Lauffenburger, Kevin M. Haigis

    Publié 2019
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  11. 11
    Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data

    Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data par Christian H. Holland, Jovan Tanevski, Javier Perales-Patón, Jan Gleixner, Manu P. Kumar, Elisabetta Mereu, Brian A. Joughin, Oliver Stegle, Douglas A. Lauffenburger, Holger Heyn, Bence Szalai, Julio Sáez-Rodríguez

    Publié 2020
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  12. 12
    Transite: A Computational Motif-Based Analysis Platform That Identifies RNA-Binding Proteins Modulating Changes in Gene Expression

    Transite: A Computational Motif-Based Analysis Platform That Identifies RNA-Binding Proteins Modulating Changes in Gene Expression par Konstantin Krismer, Molly A. Bird, Shohreh Varmeh, Erika D. Handly, Anna Gattinger, Thomas Bernwinkler, Daniel A. Anderson, Andreas Heinzel, Brian A. Joughin, Yi Wen Kong, Ian G. Cannell, Michael B. Yaffe

    Publié 2020
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  13. 13
    Proteomic Identification of 14-3-3ζ as a Mitogen-Activated Protein Kinase-Activated Protein Kinase 2 Substrate: Role in Dimer Formation and Ligand Binding

    Proteomic Identification of 14-3-3ζ as a Mitogen-Activated Protein Kinase-Activated Protein Kinase 2 Substrate: Role in Dimer Formation and Ligand Binding par David W. Powell, Madhavi J. Rane, Brian A. Joughin, Ralitsa Kalmukova, Jeong‐Ho Hong, Bruce Tidor, William L. Dean, William M. Pierce, Jon B. Klein, Michael B. Yaffe, Kenneth R. McLeish

    Publié 2003
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  14. 14
    Acidification of Tumor at Stromal Boundaries Drives Transcriptome Alterations Associated with Aggressive Phenotypes

    Acidification of Tumor at Stromal Boundaries Drives Transcriptome Alterations Associated with Aggressive Phenotypes par Nazanin Rohani, Liangliang Hao, Maria S. Alexis, Brian A. Joughin, Konstantin Krismer, Mira N. Moufarrej, Anthony R. Soltis, Douglas A. Lauffenburger, Michael B. Yaffe, Christopher B. Burge, Sangeeta N. Bhatia, Frank B. Gertler

    Publié 2019
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  15. 15
    Screening for CD19-specific chimaeric antigen receptors with enhanced signalling via a barcoded library of intracellular domains

    Screening for CD19-specific chimaeric antigen receptors with enhanced signalling via a barcoded library of intracellular domains par Khloe S. Gordon, Taeyoon Kyung, Caleb R. Perez, Patrick V. Holec, Azucena Ramos, Angela Q. Zhang, Yash Agarwal, Yunpeng Liu, Catherine Koch, Alina Starchenko, Brian A. Joughin, Douglas A. Lauffenburger, Darrell J. Irvine, Michael T. Hemann, Michael E. Birnbaum

    Publié 2022
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  16. 16
    The Fanconi anemia core complex promotes CtIP-dependent end resection to drive homologous recombination at DNA double-strand breaks

    The Fanconi anemia core complex promotes CtIP-dependent end resection to drive homologous recombination at DNA double-strand breaks par Bert van de Kooij, Fenna J. van der Wal, Magdalena B. Rother, Wouter W. Wiegant, Pau Creixell, Merula Stout, Brian A. Joughin, Julia Vornberger, Matthias Altmeyer, Marcel A.T.M. van Vugt, Michael B. Yaffe, Haico van Attikum

    Publié 2024
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  17. 17
    Spatial Exclusivity Combined with Positive and Negative Selection of Phosphorylation Motifs Is the Basis for Context-Dependent Mitotic Signaling

    Spatial Exclusivity Combined with Positive and Negative Selection of Phosphorylation Motifs Is the Basis for Context-Dependent Mitotic Signaling par Jes Alexander, Daniel Lim, Brian A. Joughin, Björn Hegemann, James R. A. Hutchins, Tobias Ehrenberger, Frank J. Ivins, Fabio Sessa, Otto Hudecz, Erich A. Nigg, Andrew M. Fry, Andrea Musacchio, P. Todd Stukenberg, Karl Mechtler, Jan‐Michael Peters, Stephen J. Smerdon, Michael B. Yaffe

    Publié 2011
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  18. 18
    Integrated mapping of pharmacokinetics and pharmacodynamics in a patient-derived xenograft model of glioblastoma

    Integrated mapping of pharmacokinetics and pharmacodynamics in a patient-derived xenograft model of glioblastoma par Elizabeth C. Randall, Kristina B. Emdal, Janice K. Laramy, Minjee Kim, Alison Roos, David Calligaris, Michael S. Regan, Shiv K. Gupta, Ann C. Mladek, Brett L. Carlson, Aaron J. Johnson, Fa-Ke Lu, Xiaoliang Sunney Xie, Brian A. Joughin, Raven J. Reddy, Sen Peng, Walid M. Abdelmoula, Pamela Jackson, Aarti Kolluri, Katherine A. Kellersberger, Jeffrey N. Agar, Douglas A. Lauffenburger, Kristin R. Swanson, Nhan L. Tran, William F. Elmquist, Forest M. White, Jann N. Sarkaria, Nathalie Y.R. Agar

    Publié 2018
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  19. 19
    Tissue-Specific Oncogenic Activity of KRASA146T

    Tissue-Specific Oncogenic Activity of KRASA146T par Emily J. Poulin, Asim K. Bera, Jia Lu, Yi-Jang Lin, Samantha Dale Strasser, João A. Paulo, Tannie Q. Huang, Carolina E. Morales, Wei Yan, Joshua Cook, Jonathan A. Nowak, Douglas K. Brubaker, Brian A. Joughin, Christian W. Johnson, Rebecca A. DeStefanis, Phaedra C. Ghazi, Sudershan Reddy Gondi, Thomas E. Wales, Roxana E. Iacob, Lana Bogdanova, Jessica J. Gierut, Yina Li, John R. Engen, Pedro A. Pérez–Mancera, Benjamin S. Braun, Steven P. Gygi, Douglas A. Lauffenburger, Kenneth D. Westover, Kevin M. Haigis

    Publié 2019
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  20. 20
    The intrinsic substrate specificity of the human tyrosine kinome

    The intrinsic substrate specificity of the human tyrosine kinome par Tomer M. Yaron, Brian A. Joughin, Emily M. Huntsman, Alexander Kerelsky, Daniel M. Cizin, Benjamin M. Cohen, Amit Regev, Junho Song, Neil Vasan, Ting-Yu Lin, Jose M. Orozco, Christina Schoenherr, Cari A. Sagum, Mark T. Bedford, Richard Wynn, Shih‐Chia Tso, David Chuang, Lei Li, Shawn S.‐C. Li, Pau Creixell, Konstantin Krismer, Mina Takegami, Harin Lee, Bin Zhang, Jingyi Lu, Ian Cossentino, Sean D. Landry, Mohamed Uduman, John Blenis, Olivier Elemento, Margaret C. Frame, Peter Hornbeck, Lewis C. Cantley, Benjamin E. Turk, Michael B. Yaffe, Jared L. Johnson

    Publié 2024
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