Výsledky vyhledávání - Banáš, Pavel

Upřesnit hledání
  1. 1
    Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of glmS riboswitch as reveled by molecular dynamics

    Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of glmS riboswitch as reveled by molecular dynamics Autor Banáš, Pavel, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2010
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  2. 2
    Theoretical studies of RNA catalysis: Hybrid QM/MM methods and their comparison with MD and QM

    Theoretical studies of RNA catalysis: Hybrid QM/MM methods and their comparison with MD and QM Autor Banáš, Pavel, Jurečka, Petr, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2009
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  3. 3
    QM/MM Studies of Hairpin Ribozyme Self-Cleavage Suggest the Feasibility of Multiple Competing Reaction Mechanisms

    QM/MM Studies of Hairpin Ribozyme Self-Cleavage Suggest the Feasibility of Multiple Competing Reaction Mechanisms Autor Mlýnský, Vojtěch, Banáš, Pavel, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2011
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  4. 4
    Molecular Mechanism of preQ(1) Riboswitch Action: A Molecular Dynamics Study

    Molecular Mechanism of preQ(1) Riboswitch Action: A Molecular Dynamics Study Autor Banáš, Pavel, Sklenovský, Petr, Wedekind, Joseph E., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2012
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  5. 5
    The Role of an Active Site Mg(2+) in HDV Ribozyme Self-Cleavage: Insights from QM/MM Calculations

    The Role of an Active Site Mg(2+) in HDV Ribozyme Self-Cleavage: Insights from QM/MM Calculations Autor Mlýnský, Vojtěch, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel

    Vydáno 2015
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  6. 6
    Chemical Feasibility of the General Acid/Base Mechanism of glmS Ribozyme Self-Cleavage

    Chemical Feasibility of the General Acid/Base Mechanism of glmS Ribozyme Self-Cleavage Autor Dubecký, Matúš, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel

    Vydáno 2015
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  7. 7
    CAVER: a new tool to explore routes from protein clefts, pockets and cavities

    CAVER: a new tool to explore routes from protein clefts, pockets and cavities Autor Petřek, Martin, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel, Košinová, Pavlína, Koča, Jaroslav, Damborský, Jiří

    Vydáno 2006
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  8. 8
    Wobble Pairs of the HDV Ribozyme Play Specific Roles in Stabilization of Active Site Dynamics

    Wobble Pairs of the HDV Ribozyme Play Specific Roles in Stabilization of Active Site Dynamics Autor Sripathi, Kamali N., Banáš, Pavel, Reblova, Kamila, Šponer, Jiři, Otyepka, Michal, Walter, Nils G.

    Vydáno 2015
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  9. 9
    Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes

    Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes Autor Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Vicherek, Lukáš, Banáš, Pavel, Otyepka, Michal, Trantírek, Lukáš, Šponer, Jiří

    Vydáno 2019
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  10. 10
    General Base Catalysis for Cleavage by the Active-Site Cytosine of the Hepatitis Delta Virus Ribozyme: QM/MM Calculations Establish Chemical Feasibility

    General Base Catalysis for Cleavage by the Active-Site Cytosine of the Hepatitis Delta Virus Ribozyme: QM/MM Calculations Establish Chemical Feasibility Autor Banáš, Pavel, Rulíšek, Lubomír, Hánošová, Veronika, Svozil, Daniel, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2008
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  11. 11
    Extensive Molecular Dynamics Simulations Show That Canonical G8 and Protonated A38H(+) Forms Are Most Consistent with Crystal Structures of Hairpin Ribozyme

    Extensive Molecular Dynamics Simulations Show That Canonical G8 and Protonated A38H(+) Forms Are Most Consistent with Crystal Structures of Hairpin Ribozyme Autor Mlýnský, Vojtěch, Banáš, Pavel, Hollas, Daniel, Réblová, Kamila, Walter, Nils G., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2010
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  12. 12
    Refinement of the Cornell et al. Nucleic Acids Force Field Based on Reference Quantum Chemical Calculations of Glycosidic Torsion Profiles

    Refinement of the Cornell et al. Nucleic Acids Force Field Based on Reference Quantum Chemical Calculations of Glycosidic Torsion Profiles Autor Zgarbová, Marie, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří, Mládek, Arnošt, Banáš, Pavel, Cheatham, Thomas E., Jurečka, Petr

    Vydáno 2011
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  13. 13
    Disparate HDV ribozyme crystal structures represent intermediates on a rugged free-energy landscape

    Disparate HDV ribozyme crystal structures represent intermediates on a rugged free-energy landscape Autor Sripathi, Kamali N., Tay, Wendy W., Banáš, Pavel, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří, Walter, Nils G.

    Vydáno 2014
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  14. 14
    Structural dynamics of propeller loop: towards folding of RNA G-quadruplex

    Structural dynamics of propeller loop: towards folding of RNA G-quadruplex Autor Havrila, Marek, Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Mergny, Jean-Louis, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří

    Vydáno 2018
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  15. 15
    Computer Folding of RNA Tetraloops: Identification of Key Force Field Deficiencies

    Computer Folding of RNA Tetraloops: Identification of Key Force Field Deficiencies Autor Kührová, Petra, Best, Robert B., Bottaro, Sandro, Bussi, Giovanni, Šponer, Jiří, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel

    Vydáno 2016
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  16. 16
    Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations

    Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations Autor Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Koča, Jaroslav, Bussi, Giovanni, Trantírek, Lukáš, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří

    Vydáno 2015
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  17. 17
    Automatic Learning of Hydrogen-Bond Fixes in the AMBER RNA Force Field

    Automatic Learning of Hydrogen-Bond Fixes in the AMBER RNA Force Field Autor Fröhlking, Thorben, Mlýnský, Vojtěch, Janeček, Michal, Kührová, Petra, Krepl, Miroslav, Banáš, Pavel, Šponer, Jiří, Bussi, Giovanni

    Vydáno 2022
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  18. 18
    Performance of Molecular Mechanics Force Fields for RNA Simulations: Stability of UUCG and GNRA Hairpins

    Performance of Molecular Mechanics Force Fields for RNA Simulations: Stability of UUCG and GNRA Hairpins Autor Banáš, Pavel, Hollas, Daniel, Zgarbová, Marie, Jurečka, Petr, Orozco, Modesto, Cheatham, Thomas E., Šponer, Jiří, Otyepka, Michal

    Vydáno 2010
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  19. 19
    Anatomy of enzyme channels

    Anatomy of enzyme channels Autor Pravda, Lukáš, Berka, Karel, Svobodová Vařeková, Radka, Sehnal, David, Banáš, Pavel, Laskowski, Roman A, Koča, Jaroslav, Otyepka, Michal

    Vydáno 2014
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  20. 20
    Reference simulations of noncanonical nucleic acids with different χ variants of the AMBER force field: quadruplex DNA, quadruplex RNA and Z-DNA

    Reference simulations of noncanonical nucleic acids with different χ variants of the AMBER force field: quadruplex DNA, quadruplex RNA and Z-DNA Autor Krepl, Miroslav, Zgarbová, Marie, Stadlbauer, Petr, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel, Koča, Jaroslav, Cheatham, Thomas E., Jurečka, Petr, Šponer, Jiří

    Vydáno 2012
    Získat plný text Získat plný text Získat plný text
    Text
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:

Vyhledávací nástroje: