Suchergebnisse - Anshul Kundaje

Treffer weiter einschränken
  1. 1
    Reverse-complement parameter sharing improves deep learning models for genomics

    Reverse-complement parameter sharing improves deep learning models for genomics von Avanti Shrikumar, Peyton Greenside, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2017
    Volltext Volltext
    Pré-impressão
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  2. 2
    GkmExplain: fast and accurate interpretation of nonlinear gapped k-mer SVMs

    GkmExplain: fast and accurate interpretation of nonlinear gapped k-mer SVMs von Avanti Shrikumar, Eva Prakash, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2019
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  3. 3
    Characterization of the direct targets of<scp>FOXO</scp>transcription factors throughout evolution

    Characterization of the direct targets of<scp>FOXO</scp>transcription factors throughout evolution von Ashley E. Webb, Anshul Kundaje, Anne Brunet

    Veröffentlicht 2016
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  4. 4
    Denoising genome-wide histone ChIP-seq with convolutional neural networks

    Denoising genome-wide histone ChIP-seq with convolutional neural networks von Pang Wei Koh, Emma Pierson, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2017
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  5. 5
    The ENCODE Blacklist: Identification of Problematic Regions of the Genome

    The ENCODE Blacklist: Identification of Problematic Regions of the Genome von Haley M. Amemiya, Anshul Kundaje, Alan P. Boyle

    Veröffentlicht 2019
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  6. 6
    Umap and Bismap: quantifying genome and methylome mappability

    Umap and Bismap: quantifying genome and methylome mappability von Mehran Karimzadeh, Carl Ernst, Anshul Kundaje, Michael M. Hoffman

    Veröffentlicht 2018
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  7. 7
    Integrating regulatory DNA sequence and gene expression to predict genome-wide chromatin accessibility across cellular contexts

    Integrating regulatory DNA sequence and gene expression to predict genome-wide chromatin accessibility across cellular contexts von Surag Nair, Daniel Sunwook Kim, Jacob Perricone, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2019
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  8. 8
    MTSplice predicts effects of genetic variants on tissue-specific splicing

    MTSplice predicts effects of genetic variants on tissue-specific splicing von Jun Cheng, Muhammed Hasan Çelik, Anshul Kundaje, Julien Gagneur

    Veröffentlicht 2021
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  9. 9
    Deciphering the impact of genetic variation on human polyadenylation using APARENT2

    Deciphering the impact of genetic variation on human polyadenylation using APARENT2 von Johannes Linder, Samantha E. Koplik, Anshul Kundaje, Georg Seelig

    Veröffentlicht 2022
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  10. 10
    Large-Scale Quality Analysis of Published ChIP-seq Data

    Large-Scale Quality Analysis of Published ChIP-seq Data von Georgi K. Marinov, Anshul Kundaje, Peter J. Park, B Wold

    Veröffentlicht 2013
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  11. 11
    Predicting genetic regulatory response using classification

    Predicting genetic regulatory response using classification von Manuel Middendorf, Anshul Kundaje, Chris Wiggins, Yoav Freund, Christina Leslie

    Veröffentlicht 2004
    Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  12. 12
    Discovering epistatic feature interactions from neural network models of regulatory DNA sequences

    Discovering epistatic feature interactions from neural network models of regulatory DNA sequences von Peyton Greenside, Tyler C. Shimko, Polly M. Fordyce, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2018
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  13. 13
    Initiation of mtDNA transcription is followed by pausing, and diverges across human cell types and during evolution

    Initiation of mtDNA transcription is followed by pausing, and diverges across human cell types and during evolution von Amit Blumberg, Edward J. Rice, Anshul Kundaje, Charles G. Danko, Dan Mishmar

    Veröffentlicht 2017
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  14. 14
    Linking disease associations with regulatory information in the human genome

    Linking disease associations with regulatory information in the human genome von Marc A. Schaub, Alan P. Boyle, Anshul Kundaje, Serafim Batzoglou, M Snyder

    Veröffentlicht 2012
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  15. 15
    Deciphering regulatory DNA sequences and noncoding genetic variants using neural network models of massively parallel reporter assays

    Deciphering regulatory DNA sequences and noncoding genetic variants using neural network models of massively parallel reporter assays von Rajiv Movva, Peyton Greenside, Georgi K. Marinov, Surag Nair, Avanti Shrikumar, Anshul Kundaje

    Veröffentlicht 2019
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  16. 16
    Transcription-dependent domain-scale three-dimensional genome organization in the dinoflagellate Breviolum minutum

    Transcription-dependent domain-scale three-dimensional genome organization in the dinoflagellate Breviolum minutum von Georgi K. Marinov, Alexandro E. Trevino, T. Xiang, Anshul Kundaje, Arthur Grossman, William J. Greenleaf

    Veröffentlicht 2021
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  17. 17
    Conserved epigenomic signals in mice and humans reveal immune basis of Alzheimer’s disease

    Conserved epigenomic signals in mice and humans reveal immune basis of Alzheimer’s disease von Elizabeta Gjoneska, Andreas Pfenning, Hansruedi Mathys, Gerald Quon, Anshul Kundaje, Li-Huei Tsai, Manolis Kellis

    Veröffentlicht 2015
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  18. 18
    Domain-adaptive neural networks improve cross-species prediction of transcription factor binding

    Domain-adaptive neural networks improve cross-species prediction of transcription factor binding von Kelly Cochran, Divyanshi Srivastava, Avanti Shrikumar, Akshay Balsubramani, Ross C. Hardison, Anshul Kundaje, Shaun Mahony

    Veröffentlicht 2022
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  19. 19
    Transfer learning reveals sequence determinants of the quantitative response to transcription factor dosage

    Transfer learning reveals sequence determinants of the quantitative response to transcription factor dosage von Sahin Naqvi, Seungsoo Kim, Saman Tabatabaee, Anusri Pampari, Anshul Kundaje, Jonathan K. Pritchard, Joanna Wysocka

    Veröffentlicht 2025
    Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:
  20. 20
    Chromatin accessibility dynamics reveal novel functional enhancers in <i>C. elegans</i>

    Chromatin accessibility dynamics reveal novel functional enhancers in <i>C. elegans</i> von Aaron C. Daugherty, Robin W. Yeo, Jason D. Buenrostro, William J. Greenleaf, Anshul Kundaje, Anne Brunet

    Veröffentlicht 2017
    Volltext Volltext
    Artigo
    Zu den Favoriten
    Gespeichert in:

Suchwerkzeuge: