Rezultaty - Aluru, Srinivas

Guest Editors’ Introduction, Special Issue on High-Performance Computational Biology od Bader, David A., Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Repeat-aware modeling and correction of short read errors od Yang, Xiao, Aluru, Srinivas, Dorman, Karin S

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Microarray Data Processing Techniques for Genome-Scale Network Inference from Large Public Repositories od Chockalingam, Sriram, Aluru, Maneesha, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A comprehensive evaluation of long read error correction methods od Zhang, Haowen, Jain, Chirag, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A variant selection framework for genome graphs od Jain, Chirag, Tavakoli, Neda, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Parallel short sequence assembly of transcriptomes od Jackson, Benjamin G, Schnable, Patrick S, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Efficient clustering of large EST data sets on parallel computers od Kalyanaraman, Anantharaman, Aluru, Srinivas, Kothari, Suresh, Brendel, Volker

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Reverse engineering and analysis of large genome-scale gene networks od Aluru, Maneesha, Zola, Jaroslaw, Nettleton, Dan, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

SNVSniffer: an integrated caller for germline and somatic single-nucleotide and indel mutations od Liu, Yongchao, Loewer, Martin, Aluru, Srinivas, Schmidt, Bertil

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Fast and Accurate Construction of Ultra-Dense Consensus Genetic Maps Using Evolution Strategy Optimization od Mester, David, Ronin, Yefim, Schnable, Patrick, Aluru, Srinivas, Korol, Abraham

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

An SVM-based method for assessment of transcription factor-DNA complex models od Corona, Rosario I., Sudarshan, Sanjana, Aluru, Srinivas, Guo, Jun-tao

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A Fast Approximate Algorithm for Mapping Long Reads to Large Reference Databases od Jain, Chirag, Dilthey, Alexander, Koren, Sergey, Aluru, Srinivas, Phillippy, Adam M.

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A fast adaptive algorithm for computing whole-genome homology maps od Jain, Chirag, Koren, Sergey, Dilthey, Alexander, Phillippy, Adam M, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

PCAP: A Whole-Genome Assembly Program od Huang, Xiaoqiu, Wang, Jianmin, Aluru, Srinivas, Yang, Shiaw-Pyng, Hillier, LaDeana

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

A greedy alignment-free distance estimator for phylogenetic inference od Thankachan, Sharma V., Chockalingam, Sriram P., Liu, Yongchao, Krishnan, Ambujam, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

An alignment-free heuristic for fast sequence comparisons with applications to phylogeny reconstruction od Chockalingam, Sriram P., Pannu, Jodh, Hooshmand, Sahar, Thankachan, Sharma V., Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries od Jain, Chirag, Rodriguez-R, Luis M., Phillippy, Adam M., Konstantinidis, Konstantinos T., Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Reply to: “Re-evaluating the evidence for a universal genetic boundary among microbial species” od Rodriguez-R, Luis M., Jain, Chirag, Conrad, Roth E., Aluru, Srinivas, Konstantinidis, Konstantinos T.

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Real-time mapping of nanopore raw signals od Zhang, Haowen, Li, Haoran, Jain, Chirag, Cheng, Haoyu, Au, Kin Fai, Li, Heng, Aluru, Srinivas

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe

Quality assessment of maize assembled genomic islands (MAGIs) and large-scale experimental verification of predicted genes od Fu, Yan, Emrich, Scott J., Guo, Ling, Wen, Tsui-Jung, Ashlock, Daniel A., Aluru, Srinivas, Schnable, Patrick S.

Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe Dokumenty pełnotekstowe